CARMIL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CARMIL1是调控肌动蛋白聚合的关键蛋白,参与细胞迁移和免疫突触形成,其异常与免疫缺陷和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CARMIL1 |
|---|---|
| 基因全名 | capping protein regulator and myosin 1 linker 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q24.1 |
| NCBI Gene ID | 139221 ncbi.nlm.nih.gov/gene/139221 |
| Ensembl ID | ENSG00000112210 |
| UniProt ID | Q5T1M5 |
| OMIM ID | 617622 |
| HGNC ID | 28964 |
| 基因别名 | LRRC16, LRRC16A, dJ380B8.2 |
基因功能与研究简介
CARMIL1(capping protein regulator and myosin 1 linker 1)编码一种参与肌动蛋白细胞骨架动态调控的蛋白。该蛋白通过结合肌动蛋白加帽蛋白(CP)和肌球蛋白I,调节肌动蛋白丝的组装,从而影响细胞迁移、吞噬和免疫突触形成等过程。CARMIL1在多种组织中表达,尤其在免疫细胞中高表达。其功能异常与免疫缺陷和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷 | CARMIL1突变导致蛋白功能丧失,影响T细胞活化及免疫突触形成,导致免疫缺陷 | ClinVar, OMIM |
| 癌症 | CARMIL1表达异常与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)的侵袭和转移相关,但具体机制尚在研究中 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞系 |
| Ramos | 暂无可靠数据 | B细胞系 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.567_568del (p.Glu190fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,影响肌动蛋白调控,导致细胞迁移和免疫突触形成缺陷。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003779 (actin binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• Fc gamma R-mediated phagocytosis (KEGG: hsa04666)
蛋白质功能简介
CARMIL1蛋白包含LRR结构域和C端区域,通过其N端与肌动蛋白加帽蛋白(CP)结合,C端与肌球蛋白I结合,从而调节肌动蛋白丝的组装。该蛋白在细胞前缘富集,促进肌动蛋白聚合,驱动细胞迁移。在免疫细胞中,CARMIL1参与免疫突触的形成,对T细胞活化至关重要。