CBX3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CBX3(Chromobox 3)是异染色质蛋白1家族成员,参与基因沉默、DNA损伤修复和细胞周期调控,与多种癌症和发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 CBX3
基因全名 Chromobox 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p15.2
NCBI Gene ID 11335 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11335
Ensembl ID ENSG00000173757
UniProt ID Q13185
OMIM ID 609377
HGNC ID 1555
基因别名 HP1 gamma, HP1-GAMMA, HECH

基因功能与研究简介

CBX3(Chromobox 3)编码异染色质蛋白1家族成员HP1 gamma。该蛋白在异染色质形成、基因沉默、DNA损伤修复和细胞周期调控中发挥关键作用。CBX3通过识别组蛋白H3赖氨酸9三甲基化(H3K9me3)标记,参与染色质结构调控。研究表明,CBX3在多种癌症中异常表达,影响肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 CBX3在多种癌症中表达上调,可能通过调控细胞增殖和凋亡相关基因促进肿瘤发生。 较强研究证据
发育障碍 CBX3突变可能导致发育异常,但具体机制尚不明确。 潜在关联
免疫疾病 CBX3可能参与免疫细胞功能调控,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456delA (p.Lys152fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变可能导致蛋白截短,丧失正常功能,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CBX3突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明CBX3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003682 (chromatin binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006325 (chromatin organization)
• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006974 (DNA damage response)
• GO:0007049 (cell cycle)

相关通路

hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa04110 (Cell cycle)
hsa03430 (Mismatch repair)

蛋白质功能简介

CBX3蛋白属于异染色质蛋白1(HP1)家族,包含一个N端chromodomain和一个C端chromoshadow domain。该蛋白通过识别H3K9me3标记,参与异染色质形成和基因沉默。CBX3在细胞核中广泛表达,与DNA损伤修复、端粒维持和细胞周期调控密切相关。

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