CCDC50基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CCDC50编码卷曲螺旋结构域蛋白50,参与细胞信号转导和自噬调控,其突变与非综合征性听力损失相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CCDC50 |
|---|---|
| 基因全名 | coiled-coil domain containing 50 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q28 |
| NCBI Gene ID | 152137 ncbi.nlm.nih.gov/gene/152137 |
| Ensembl ID | ENSG00000152484 |
| UniProt ID | Q8IVM0 |
| OMIM ID | 611051 |
| HGNC ID | 18122 |
| 基因别名 | Ymer |
基因功能与研究简介
CCDC50基因编码卷曲螺旋结构域蛋白50,该蛋白在多种组织中表达,参与细胞信号转导和自噬调控。研究表明,CCDC50与表皮生长因子受体(EGFR)信号通路相关,可能通过调节自噬影响细胞稳态。CCDC50的突变与非综合征性听力损失(DFNA44)相关,提示其在听觉系统功能中的重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非综合征性听力损失(DFNA44) | CCDC50基因突变导致常染色体显性遗传性听力损失,可能通过单倍剂量不足或显性负效应影响内耳毛细胞功能。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | CCDC50在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 耳蜗 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于免疫组化) |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.358C>T (p.Arg120Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能引起单倍剂量不足 |
| c.494G>A (p.Trp165Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短 |
| c.1015C>T (p.Arg339Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,如无义突变导致蛋白截短,可能通过单倍剂量不足引起疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0006914 autophagy | • GO:0007165 signal transduction |
相关通路
• EGFR signaling pathway (Reactome: R-HSA-177929)
• Autophagy (KEGG: hsa04140)
蛋白质功能简介
CCDC50蛋白包含卷曲螺旋结构域,定位于细胞质,参与自噬调控和EGFR信号通路。该蛋白可能通过调节自噬影响细胞存活和稳态。在听觉系统中,CCDC50对于内耳毛细胞的正常功能至关重要,其突变导致听力损失。