CCDC6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CCDC6基因编码卷曲螺旋结构域蛋白6,参与DNA损伤修复和细胞凋亡,其融合基因在多种癌症中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | CCDC6 |
|---|---|
| 基因全名 | coiled-coil domain containing 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q21.2 |
| NCBI Gene ID | 8030 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8030 |
| Ensembl ID | ENSG00000108091 |
| UniProt ID | Q16204 |
| OMIM ID | 601985 |
| HGNC ID | 1876 |
| 基因别名 | H4; D10S170; PTC; TPC |
基因功能与研究简介
CCDC6基因编码一种卷曲螺旋结构域蛋白,参与DNA损伤应答和细胞凋亡调控。该基因在多种实体瘤中发生重排,形成融合基因,如RET-CCDC6(甲状腺癌)和CCDC6-RET(非小细胞肺癌),导致激酶活性异常激活,促进肿瘤发生。此外,CCDC6还参与维持基因组稳定性,其功能缺失可能增加癌症风险。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 甲状腺乳头状癌 | CCDC6与RET基因融合形成RET-CCDC6融合基因,导致RET激酶组成性激活,驱动肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 非小细胞肺癌 | CCDC6与RET基因融合形成CCDC6-RET融合基因,激活RET信号通路,促进肿瘤增殖。 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | CCDC6表达异常或突变可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | CCDC6表达下调与预后不良相关,可能通过影响DNA损伤修复促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 正常甲状腺组织表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 正常肺组织表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 正常结肠组织表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 正常乳腺组织表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| NCI-H2228 | 暂无可靠数据 | 非小细胞肺癌细胞系,携带CCDC6-RET融合 |
| TPC-1 | 暂无可靠数据 | 甲状腺乳头状癌细胞系,携带RET-CCDC6融合 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,CCDC6表达正常 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| CCDC6-RET融合 | 基因融合 | 在甲状腺癌中约5-10%,在NSCLC中约1-2% | Gain of Function:导致RET激酶组成性激活,促进细胞增殖 |
| CCDC6缺失突变 | 缺失 | 罕见 | Loss of Function:可能影响DNA损伤修复,增加基因组不稳定性 |
| CCDC6错义突变 | 错义突变 | 罕见 | 暂无明确功能影响 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,可能导致CCDC6蛋白功能丧失,影响DNA损伤修复和细胞凋亡,增加基因组不稳定性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,如CCDC6-RET融合,导致RET激酶活性异常激活,驱动肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CCDC6突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006281 DNA repair |
| • GO:0006915 apoptotic process |
相关通路
• hsa05223 Non-small cell lung cancer
• hsa05216 Thyroid cancer
• hsa04012 ErbB signaling pathway
蛋白质功能简介
CCDC6蛋白由474个氨基酸组成,含有卷曲螺旋结构域,定位于细胞核和细胞质。该蛋白参与DNA损伤应答,与ATM/ATR信号通路相关,调控细胞周期检查点和凋亡。在癌症中,CCDC6基因重排导致融合蛋白产生,异常激活下游信号通路,促进肿瘤发生。
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