CCDC9基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
CCDC9(卷曲螺旋结构域蛋白9)是一个功能尚未完全阐明的基因,可能参与细胞骨架组织、细胞周期调控及肿瘤发生,其突变与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CCDC9 |
|---|---|
| 基因全名 | coiled-coil domain containing 9 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.32 |
| NCBI Gene ID | 26009 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26009 |
| Ensembl ID | ENSG00000105617 |
| UniProt ID | Q9Y2G2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:26563 |
| 基因别名 | FLJ12684, MGC126688, dJ1013A10.3 |
基因功能与研究简介
CCDC9(coiled-coil domain containing 9)是一个编码卷曲螺旋结构域蛋白的基因,位于人类染色体19q13.32。该基因编码的蛋白质含有卷曲螺旋结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。目前,CCDC9的功能尚未完全阐明,但已有研究表明其可能参与细胞骨架组织、细胞周期调控以及肿瘤发生。在多种癌症中观察到CCDC9的表达异常或突变,提示其可能在肿瘤发生和发展中扮演一定角色。然而,其具体分子机制和生理功能仍需进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | CCDC9在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 较强研究证据(PMID: 31270520) |
| 结直肠癌 | CCDC9在结直肠癌中表达异常,可能作为潜在的肿瘤抑制因子或癌基因,但证据有限。 | 潜在关联(PMID: 28925394) |
| 乳腺癌 | CCDC9在乳腺癌中表达水平与预后相关,可能参与肿瘤进展,但机制未明。 | 潜在关联(PMID: 30530634) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝细胞癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白质截短,功能丧失(Loss of Function) |
| c.567_568insA (p.Gln190ThrfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白质截短,功能丧失(Loss of Function) |
| c.890A>G (p.Glu297Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质结构,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变和移码突变可能导致蛋白质截短,从而丧失正常功能,可能通过单倍剂量不足或显性负效应影响细胞过程。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CCDC9突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CCDC9突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005815 (microtubule organizing center) |
相关通路
• 暂无可靠数据
蛋白质功能简介
CCDC9蛋白含有卷曲螺旋结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。亚细胞定位可能在细胞质和中心体,提示其可能参与细胞骨架组织和细胞分裂。然而,其具体功能尚不明确,需要进一步研究。
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