CCL21基因|基因功能、疾病关联、突变与免疫研究

CCL21是趋化因子家族成员,通过CCR7受体调控免疫细胞迁移,在免疫应答、炎症及肿瘤免疫中发挥关键作用。

基因信息卡

基因符号 CCL21
基因全名 C-C motif chemokine ligand 21
基因类型 protein-coding
染色体位置 9p13.3
NCBI Gene ID 6366 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6366
Ensembl ID ENSG00000137077
UniProt ID O00585
OMIM ID 602737
HGNC ID 10624
基因别名 6Ckine, SCYA21, SLC, TCA4, CKb9, ECL

基因功能与研究简介

CCL21(C-C基序趋化因子配体21)是趋化因子家族成员,主要表达于次级淋巴器官的高内皮微静脉和基质细胞。CCL21与其受体CCR7结合,介导T细胞、B细胞和树突状细胞的趋化迁移,对于淋巴结归巢和免疫应答的启动至关重要。此外,CCL21还参与胸腺T细胞发育、炎症反应及肿瘤免疫调节。CCL21的异常表达与多种疾病相关,包括自身免疫性疾病、慢性炎症和肿瘤。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
类风湿性关节炎 CCL21在滑膜组织中高表达,促进炎症细胞浸润,参与关节破坏。 较强研究证据
多发性硬化 CCL21在脑脊液中升高,可能促进免疫细胞进入中枢神经系统,加重神经炎症。 潜在关联
肿瘤 CCL21在多种肿瘤中表达异常,可促进肿瘤相关淋巴组织形成,影响抗肿瘤免疫应答。 癌症相关
原发性免疫缺陷 CCL21/CCR7轴缺陷可导致淋巴细胞归巢障碍,但直接致病突变罕见。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
小肠 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 内皮细胞
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>A (p.Cys41Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.456_457del (p.Leu153fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致CCL21蛋白截短或降解,影响趋化功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008009 (chemokine activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0006955 (immune response)
• GO:0006935 (chemotaxis) • GO:0048247 (lymphocyte chemotaxis)

相关通路

Reactome: Chemokine receptors bind chemokines (R-HSA-373076)
KEGG: Chemokine signaling pathway (hsa04062)

蛋白质功能简介

CCL21蛋白由134个氨基酸组成,属于CC趋化因子家族。其前体蛋白经信号肽切割后分泌至细胞外,包含保守的CC基序。CCL21通过结合受体CCR7,激活G蛋白偶联信号通路,介导细胞骨架重排和定向迁移。CCL21在次级淋巴器官中高表达,对免疫细胞归巢至关重要。

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