CCL3L1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CCL3L1是趋化因子CCL3的拷贝数变异基因,其拷贝数与HIV感染易感性及炎症性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 CCL3L1
基因全名 C-C motif chemokine ligand 3 like 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q12
NCBI Gene ID 6349 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6349
Ensembl ID ENSG00000276070
UniProt ID P16619
OMIM ID 601383
HGNC ID 10638
基因别名 LD78 beta, SCYA3L1, D17S1718, G0S19-2, MIP-1 alpha, MIP1A, MIP-1-alpha, PAT 744.2, SCYA3L

基因功能与研究简介

CCL3L1基因编码CCL3(巨噬细胞炎症蛋白-1α)的类似物,属于趋化因子CC家族。该基因位于染色体17q12,存在高度拷贝数变异(CNV),不同个体间拷贝数差异显著。CCL3L1蛋白与CCL3相似,可结合CCR1、CCR5等受体,参与免疫调节和炎症反应。其拷贝数与HIV感染易感性、自身免疫性疾病及某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
HIV感染/艾滋病 CCL3L1拷贝数低与HIV感染风险增加及疾病进展相关,可能通过竞争性抑制HIV与CCR5结合。 较强研究证据
类风湿关节炎 CCL3L1表达水平与炎症反应相关,可能参与关节炎症和破坏。 潜在关联
肝细胞癌 CCL3L1表达异常可能影响肿瘤微环境和免疫逃逸。 潜在关联
系统性红斑狼疮 CCL3L1拷贝数变异可能影响免疫调节,与SLE易感性相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血白细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
拷贝数变异(CNV) CNV 人群中常见,拷贝数0-10不等 拷贝数低与HIV易感性增加相关;拷贝数高可能增加炎症风险
rs2853698 SNP 常见 可能影响CCL3L1表达水平,与HIV感染相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

拷贝数缺失导致CCL3L1表达减少,可能减弱对HIV的竞争性抑制,增加感染风险。

Gain of Function(功能获得,GOF)

拷贝数增加导致CCL3L1表达升高,可能增强炎症反应,与自身免疫病相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008009 (chemokine activity) • GO:0005615 (extracellular space)
• GO:0006955 (immune response) • GO:0006954 (inflammatory response)
• GO:0016493 (C-C chemokine receptor binding)

相关通路

hsa04062 (Chemokine signaling pathway)
hsa04060 (Cytokine-cytokine receptor interaction)
hsa05142 (Chagas disease)
hsa05164 (Influenza A)

蛋白质功能简介

CCL3L1蛋白是趋化因子CCL3的类似物,由92个氨基酸组成,属于CC趋化因子家族。它主要作为分泌性蛋白,通过结合CCR1、CCR5等受体,招募和激活白细胞,参与炎症和免疫应答。CCL3L1与CCL3高度同源,但具有不同的受体亲和力和功能。其表达受基因拷贝数影响,在个体间差异显著。

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