CCL5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CCL5(RANTES)是关键的趋化因子,在免疫调节、炎症反应及多种疾病中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | CCL5 |
|---|---|
| 基因全名 | C-C Motif Chemokine Ligand 5 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 17q12 |
| NCBI Gene ID | 6352 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6352 |
| Ensembl ID | ENSG00000271503 |
| UniProt ID | P13501 |
| OMIM ID | 187011 |
| HGNC ID | 10632 |
| 基因别名 | RANTES, SIS-delta, SCYA5, D17S136E, eoCP |
基因功能与研究简介
CCL5(C-C Motif Chemokine Ligand 5),又称RANTES,是一种趋化因子,属于CC趋化因子家族。它由多种细胞类型表达,包括T细胞、巨噬细胞、血小板等,在炎症反应中发挥关键作用,能够趋化白细胞至炎症部位。CCL5通过与受体(如CCR1、CCR3、CCR5)结合,参与免疫调节、炎症、病毒感染(如HIV)及肿瘤进展等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 炎症性疾病 | CCL5在炎症反应中高表达,促进白细胞浸润,参与多种炎症性疾病如类风湿关节炎、动脉粥样硬化等。 | 较强研究证据 |
| HIV感染 | CCL5是HIV-1的抑制因子,通过与CCR5受体结合竞争性抑制病毒进入细胞。 | 已明确致病机制 |
| 癌症 | CCL5在多种肿瘤中表达上调,促进肿瘤微环境中的免疫细胞浸润,可能影响肿瘤进展和转移。 | 潜在关联 |
| 过敏性疾病 | CCL5参与嗜酸性粒细胞和T细胞趋化,与哮喘、过敏性鼻炎等疾病相关。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| T细胞 | 暂无可靠数据 | 活化后高表达 |
| 巨噬细胞 | 暂无可靠数据 | 炎症刺激后表达 |
| 血小板 | 暂无可靠数据 | 活化后释放 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs2107538 | SNP | 常见 | 可能影响CCL5表达水平,与疾病易感性相关 |
| rs2280788 | SNP | 常见 | 可能影响CCL5表达水平,与疾病易感性相关 |
| rs2280789 | SNP | 常见 | 可能影响CCL5表达水平,与疾病易感性相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明CCL5存在功能性缺失突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CCL5存在功能性获得突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CCL5存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008009 | • GO:0005615 |
| • GO:0005125 | • GO:0006954 |
| • GO:0006935 | • GO:0048247 |
相关通路
• hsa04062
• hsa04060
• hsa05162
蛋白质功能简介
CCL5蛋白是一种由68个氨基酸组成的趋化因子,属于CC趋化因子家族。它含有4个保守的半胱氨酸残基,形成两个二硫键,对维持其结构至关重要。CCL5以可溶性形式分泌,也可与细胞外基质结合。它通过与G蛋白偶联受体(如CCR1、CCR3、CCR5)结合,激活下游信号通路,介导细胞趋化、激活和增殖。