CCNDBP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CCNDBP1(Cyclin D1 Binding Protein 1)是细胞周期调控的重要辅助因子,参与细胞增殖、分化及凋亡,与多种肿瘤和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CCNDBP1 |
|---|---|
| 基因全名 | Cyclin D1 Binding Protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q15.2 |
| NCBI Gene ID | 23582 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23582 |
| Ensembl ID | ENSG00000137807 |
| UniProt ID | O95273 |
| OMIM ID | 607269 |
| HGNC ID | 15879 |
| 基因别名 | GCIP, HHM, DIP1, hGCIP |
基因功能与研究简介
CCNDBP1(Cyclin D1 Binding Protein 1)编码一种与细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)相互作用的蛋白,参与细胞周期调控、细胞增殖和分化。该蛋白在多种组织中表达,尤其在心脏和骨骼肌中高表达。研究表明,CCNDBP1可能作为肿瘤抑制因子,在多种癌症中表达下调,与肿瘤的发生发展相关。此外,CCNDBP1还参与细胞凋亡和DNA损伤应答等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | CCNDBP1表达下调与肿瘤进展相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤发生 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | CCNDBP1在肝癌中表达降低,与预后不良相关,可能作为抑癌基因 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CCNDBP1表达异常与乳腺癌细胞增殖和侵袭相关 | 潜在关联 |
| 胃癌 | CCNDBP1表达下调与胃癌分期和转移相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于UniProt) |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于UniProt) |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达(基于UniProt) |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达(基于UniProt) |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达(基于UniProt) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系,内源性表达未知 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,表达水平未知 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,表达可能下调 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系,表达可能下调 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但临床意义未明 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能丧失抑制细胞增殖的功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CCNDBP1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CCNDBP1存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0008283 (cell population proliferation) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• Cell Cycle
• Mitotic (Reactome: R-HSA-69278)
• Cyclin D associated events in G1 (Reactome: R-HSA-69231)
蛋白质功能简介
CCNDBP1蛋白(UniProt O95273)由299个氨基酸组成,分子量约33 kDa。该蛋白含有核定位信号,主要定位于细胞核,也可在细胞质中检测到。CCNDBP1与Cyclin D1直接结合,可能通过抑制Cyclin D1/CDK4复合物的活性来调控细胞周期G1/S转换。此外,CCNDBP1还参与转录调控和细胞凋亡。在多种肿瘤中,CCNDBP1表达下调,提示其可能作为肿瘤抑制因子。