CCNK基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CCNK编码细胞周期蛋白K,是转录调控和细胞周期进程的关键因子,与多种癌症和发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 CCNK
基因全名 Cyclin K
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q32.2
NCBI Gene ID 8812 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8812
Ensembl ID ENSG00000100811
UniProt ID O75907
OMIM ID 603544
HGNC ID 1577
基因别名 CPC; CPR4; MGC9115

基因功能与研究简介

CCNK基因编码细胞周期蛋白K,是细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的调节亚基,主要与CDK12和CDK13形成复合物,参与RNA聚合酶II的磷酸化,调控转录延伸和mRNA加工。CCNK在细胞周期调控、DNA损伤应答和基因表达调控中发挥重要作用。研究表明,CCNK的异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) CCNK表达异常或突变可能影响CDK12/13活性,导致转录失调,促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
智力障碍 CCNK突变可能导致神经发育异常,与智力障碍相关。 潜在关联
小头畸形 CCNK突变可能影响大脑发育,导致小头畸形。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
大脑 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 可能导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,可能导致CCNK蛋白活性降低或缺失,影响CDK12/13复合物功能,导致转录失调。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,可能增强CCNK活性,促进细胞增殖,与癌症相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰正常CCNK功能,影响细胞周期和转录调控。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006468 protein phosphorylation • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0007049 cell cycle

相关通路

Cell Cycle
RNA Polymerase II Transcription

蛋白质功能简介

CCNK蛋白属于细胞周期蛋白家族,包含细胞周期蛋白N端结构域,与CDK12或CDK13结合形成复合物,磷酸化RNA聚合酶II的C端结构域,调控转录延伸。CCNK在细胞周期中表达水平有波动,参与DNA损伤应答和基因表达调控。

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