CD109基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CD109是一种糖基磷脂酰肌醇锚定糖蛋白,参与TGF-β信号调控,与多种癌症和免疫疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CD109 |
|---|---|
| 基因全名 | CD109 molecule |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q13 |
| NCBI Gene ID | 135228 ncbi.nlm.nih.gov/gene/135228 |
| Ensembl ID | ENSG00000156535 |
| UniProt ID | Q6YHK3 |
| OMIM ID | 618644 |
| HGNC ID | 21688 |
| 基因别名 | CPAMD5, p180, r150 |
基因功能与研究简介
CD109(CD109 molecule)是一种糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定的细胞表面糖蛋白,属于α2-巨球蛋白(α2-macroglobulin)超家族。CD109在多种细胞类型中表达,包括造血干细胞、间充质干细胞、角质形成细胞和多种癌细胞。CD109通过负调控转化生长因子-β(TGF-β)信号通路,参与细胞增殖、分化、迁移和凋亡等过程。研究表明,CD109在多种癌症中异常表达,与肿瘤进展和不良预后相关。此外,CD109还参与免疫调节和炎症反应。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | CD109在多种癌症中高表达,可能通过促进TGF-β信号抑制、增强细胞增殖和迁移来促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 免疫相关疾病 | CD109在T细胞和树突状细胞中表达,可能参与免疫调节,与自身免疫性疾病相关。 | 潜在关联 |
| 间充质干细胞分化异常 | CD109影响间充质干细胞的分化,可能参与骨和软骨发育异常。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HaCaT(角质形成细胞) | 暂无可靠数据 | CD109表达较高 |
| MCF7(乳腺癌细胞) | 暂无可靠数据 | CD109表达较高 |
| A549(肺癌细胞) | 暂无可靠数据 | CD109表达较高 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Ser152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明CD109存在功能缺失突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CD109存在功能获得突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CD109存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) | • GO:0009986 (cell surface) |
| • GO:0043235 (receptor complex) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
蛋白质功能简介
CD109蛋白是一种GPI锚定的糖蛋白,属于α2-巨球蛋白超家族。它由1445个氨基酸组成,包含一个信号肽、一个α-2-巨球蛋白结构域和一个GPI锚定信号。CD109主要定位在细胞表面,通过结合TGF-β受体复合物抑制TGF-β信号传导。CD109在多种组织中表达,尤其在皮肤、肺和乳腺中。其表达水平在多种癌症中上调,与肿瘤侵袭和转移相关。