CD58基因|基因功能、疾病关联、突变与免疫研究
CD58(LFA-3)是T细胞激活和免疫突触形成的关键共刺激分子,在自身免疫病和肿瘤免疫中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | CD58 |
|---|---|
| 基因全名 | CD58 molecule |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p13.1 |
| NCBI Gene ID | 965 ncbi.nlm.nih.gov/gene/965 |
| Ensembl ID | ENSG00000116815 |
| UniProt ID | P19256 |
| OMIM ID | 153420 |
| HGNC ID | 1698 |
| 基因别名 | LFA-3, LFA3, ag3 |
基因功能与研究简介
CD58(CD58 molecule),又称LFA-3(淋巴细胞功能相关抗原3),是一种细胞表面糖蛋白,属于免疫球蛋白超家族。CD58在多种细胞中表达,包括抗原提呈细胞、内皮细胞和肿瘤细胞,通过与T细胞表面的CD2受体结合,促进T细胞激活和免疫突触的形成。CD58在免疫应答中发挥关键作用,其表达异常与多种疾病相关,包括自身免疫病和肿瘤免疫逃逸。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多发性硬化 | CD58基因变异与多发性硬化风险相关,可能通过影响免疫调节功能参与疾病发生。 | GWAS研究(PMID: 21833088) |
| 类风湿关节炎 | CD58表达异常可能参与类风湿关节炎的免疫病理过程。 | 研究证据(PMID: 24082162) |
| B细胞淋巴瘤 | CD58基因突变或缺失导致CD58表达下调,使肿瘤细胞逃避免疫监视。 | COSMIC数据库、研究证据(PMID: 24677525) |
| 急性淋巴细胞白血病 | CD58表达缺失与疾病复发和免疫逃逸相关。 | 研究证据(PMID: 24677525) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 全血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系 |
| Raji | 暂无可靠数据 | Burkitt淋巴瘤细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能异常 |
| c.487C>T (p.Arg163Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响CD58与CD2的结合,导致免疫调节功能受损 |
| 基因缺失 | 拷贝数变异 | 在淋巴瘤中常见 | 导致CD58表达缺失,肿瘤细胞逃避免疫监视 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致CD58蛋白表达减少或功能丧失,常见于肿瘤细胞,使其逃避免疫监视。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明CD58存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据表明CD58存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway) |
| • GO:0002250 (adaptive immune response) |
相关通路
• hsa04650 (Natural killer cell mediated cytotoxicity)
• hsa04660 (T cell receptor signaling pathway)
• hsa05340 (Primary immunodeficiency)
蛋白质功能简介
CD58蛋白是一种I型跨膜糖蛋白,由250个氨基酸组成,包含一个N端免疫球蛋白样结构域、一个跨膜区和一个短的胞内尾。CD58通过其胞外结构域与T细胞表面的CD2受体结合,增强T细胞与抗原提呈细胞之间的黏附,并促进T细胞激活。CD58在多种免疫细胞和肿瘤细胞中表达,其表达水平影响免疫应答的强度。