CDCP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CDCP1(CUB domain-containing protein 1)是一种跨膜蛋白,在多种癌症中高表达,参与肿瘤侵袭与转移,是潜在的癌症治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | CDCP1 |
|---|---|
| 基因全名 | CUB domain containing protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p21.31 |
| NCBI Gene ID | 64866 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64866 |
| Ensembl ID | ENSG00000163814 |
| UniProt ID | Q9H5V8 |
| OMIM ID | 611735 |
| HGNC ID | 24291 |
| 基因别名 | CD318, TRASK, SIMA135, CUB domain-containing protein 1 |
基因功能与研究简介
CDCP1(CUB domain containing protein 1)是一种I型跨膜蛋白,属于CUB domain家族。该蛋白在多种上皮来源的肿瘤中高表达,包括肺癌、结肠癌、乳腺癌、胰腺癌等,而在正常组织中表达较低。CDCP1参与细胞粘附、迁移、侵袭和信号转导,通过其胞内域与Src家族激酶相互作用,激活下游信号通路,促进肿瘤进展。研究表明,CDCP1的表达与肿瘤的侵袭性和不良预后相关,因此成为癌症诊断和治疗的潜在靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肺癌 | CDCP1在非小细胞肺癌中高表达,促进肿瘤细胞侵袭和转移,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结肠癌 | CDCP1在结肠癌组织中表达上调,参与肿瘤进展和转移。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CDCP1在三阴性乳腺癌中高表达,与肿瘤侵袭和转移相关。 | 较强研究证据 |
| 胰腺癌 | CDCP1在胰腺癌中高表达,促进肿瘤生长和转移。 | 较强研究证据 |
| 肾细胞癌 | CDCP1在肾细胞癌中表达升高,与肿瘤分期和分级相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 (肺癌) | 暂无可靠数据 | CDCP1高表达 |
| HCT116 (结肠癌) | 暂无可靠数据 | CDCP1高表达 |
| MDA-MB-231 (乳腺癌) | 暂无可靠数据 | CDCP1高表达 |
| PANC-1 (胰腺癌) | 暂无可靠数据 | CDCP1高表达 |
| 786-O (肾细胞癌) | 暂无可靠数据 | CDCP1表达中等 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.T412A) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.567C>T (p.R189*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.890_891insA (p.N297Kfs*2) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短,可能丧失功能,但CDCP1在癌症中通常高表达,功能丧失突变可能不常见。
Gain of Function(功能获得,GOF)
错义突变可能增强蛋白稳定性或信号传导,但缺乏明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0016477 (cell migration) |
| • GO:0007165 (signal transduction) |
相关通路
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
CDCP1蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含胞外CUB结构域和胞内酪氨酸磷酸化位点。胞外CUB结构域介导细胞粘附,胞内域可被Src家族激酶磷酸化,招募下游信号分子如PKCδ,激活Rac1和Cdc42,促进细胞迁移和侵袭。CDCP1在多种癌症中高表达,与肿瘤的侵袭性和不良预后相关,是潜在的癌症治疗靶点。