CDH19基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CDH19编码钙黏蛋白家族成员,参与细胞黏附与神经嵴发育,与遗传性耳聋及肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 CDH19
基因全名 Cadherin 19
基因类型 protein-coding
染色体位置 18q22.1
NCBI Gene ID 28513 ncbi.nlm.nih.gov/gene/28513
Ensembl ID ENSG00000120942
UniProt ID Q9H159
OMIM ID 603016
HGNC ID 1754
基因别名 CDH7L2

基因功能与研究简介

CDH19(Cadherin 19)属于钙黏蛋白超家族,编码一种II型经典钙黏蛋白。该蛋白是钙依赖性细胞黏附分子,参与胚胎发育、组织形态发生和神经嵴细胞迁移。CDH19在神经嵴衍生细胞中表达,对周围神经系统和黑色素细胞的发育至关重要。研究表明,CDH19突变与遗传性耳聋(DFNA69)相关,并在多种肿瘤中异常表达,影响肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体显性遗传性耳聋69型 CDH19基因突变导致耳蜗毛细胞黏附功能异常,影响听觉信号传导。 ClinVar, OMIM
黑色素瘤 CDH19表达下调与黑色素瘤侵袭和转移相关,可能通过影响细胞黏附促进上皮-间质转化。 COSMIC, PubMed
结直肠癌 CDH19表达异常与结直肠癌进展相关,可能参与肿瘤细胞迁移和侵袭。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
周围神经 暂无可靠数据 暂无可靠数据
内耳 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
黑色素瘤细胞系 暂无可靠数据 表达可能下调
结直肠癌细胞系 暂无可靠数据 表达可能异常
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1003C>T (p.Arg335Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,可能引发耳聋
c.1252G>A (p.Asp418Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失,与耳聋相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005509 (calcium ion binding)
• GO:0016021 (integral component of membrane)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (KEGG: hsa04514)
Adherens junction (KEGG: hsa04520)

蛋白质功能简介

CDH19蛋白属于II型经典钙黏蛋白,由784个氨基酸组成,包含胞外钙黏蛋白重复结构域、跨膜区和胞内结构域。该蛋白介导钙依赖性细胞间黏附,在神经嵴发育中起关键作用。CDH19在多种组织中表达,尤其在神经嵴衍生细胞中丰富。其突变或表达异常与遗传性耳聋和肿瘤进展相关。

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