CDH2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CDH2编码N-钙黏蛋白,是细胞黏附的关键分子,参与胚胎发育、组织形态发生及肿瘤进展。
基因信息卡
| 基因符号 | CDH2 |
|---|---|
| 基因全名 | cadherin 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 18q12.1 |
| NCBI Gene ID | 1000 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1000 |
| Ensembl ID | ENSG00000170558 |
| UniProt ID | P19022 |
| OMIM ID | 114020 |
| HGNC ID | 1756 |
| 基因别名 | CDHN, NCAD, CD325 |
基因功能与研究简介
CDH2基因编码N-钙黏蛋白(N-cadherin),属于钙黏蛋白超家族,是依赖钙离子的跨膜糖蛋白,介导细胞间同嗜性黏附。N-钙黏蛋白在神经、心脏、骨骼肌等多种组织中表达,参与胚胎发育、组织形态发生、细胞迁移和信号转导。其异常表达与肿瘤侵袭转移、纤维化及遗传性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性痉挛性截瘫 | CDH2突变可能导致神经发育异常,影响轴突导向和突触形成,但具体机制尚在研究中。 | 暂无明确证据 |
| 黑色素瘤 | CDH2过表达促进黑色素瘤细胞侵袭和转移,通过上皮-间质转化(EMT)机制。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CDH2异常表达与乳腺癌的侵袭性表型相关,可能通过促进细胞迁移和血管拟态形成。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | CDH2表达上调与胃癌的进展和不良预后相关,可能参与肿瘤微环境重塑。 | 潜在关联 |
| 前列腺癌 | CDH2在神经内分泌前列腺癌中高表达,与肿瘤神经浸润和转移相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,低表达 |
| MDA-MB-231 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,高表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系,中等表达 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系,低表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白折叠和黏附功能 |
| c.1567G>A (p.Val523Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响钙离子结合域 |
| c.2010delC (p.Leu671Trpfs*13) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白功能丧失或显著降低,可能影响细胞黏附,与发育异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
增强蛋白活性或表达,可能促进肿瘤侵袭和转移。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
突变蛋白干扰正常蛋白功能,可能影响细胞黏附稳定性。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0005509 (calcium ion binding) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0005912 (adherens junction) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) |
相关通路
• Adherens junction (KEGG: hsa04520)
• Cell adhesion molecules (CAMs) (KEGG: hsa04514)
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
蛋白质功能简介
N-钙黏蛋白(N-cadherin)由CDH2基因编码,是一种经典的II型钙黏蛋白,由胞外域(含5个钙黏蛋白重复序列)、跨膜域和胞内域组成。胞外域介导钙依赖性同嗜性黏附,胞内域通过连环蛋白(catenin)与肌动蛋白细胞骨架连接。N-钙黏蛋白在神经发育中调控轴突生长和突触形成,在心脏发育中参与心肌细胞黏附。在肿瘤中,N-钙黏蛋白的异常表达促进上皮-间质转化(EMT),增强细胞迁移和侵袭能力。
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