CDH23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CDH23编码内耳毛细胞和视网膜光感受器中的钙黏蛋白,其突变导致Usher综合征和耳聋,是遗传性听力损失的重要致病基因。
基因信息卡
| 基因符号 | CDH23 |
|---|---|
| 基因全名 | cadherin-related 23 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q22.1 |
| NCBI Gene ID | 64072 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64072 |
| Ensembl ID | ENSG00000107736 |
| UniProt ID | Q9H251 |
| OMIM ID | 605516 |
| HGNC ID | 1919 |
| 基因别名 | USH1D, DFNB12, PITA3 |
基因功能与研究简介
CDH23基因编码一种钙黏蛋白相关蛋白,属于钙黏蛋白超家族。该蛋白在内耳毛细胞和视网膜光感受器中表达,参与机械感觉毛束的形成和维持,以及光感受器突触的完整性。CDH23基因突变可导致常染色体隐性遗传的非综合征型耳聋(DFNB12)和Usher综合征1D型(USH1D),后者伴有视网膜色素变性。此外,CDH23基因变异也与年龄相关性听力损失和噪声性听力损失的风险相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Usher综合征1D型 | CDH23基因突变导致内耳毛细胞和视网膜光感受器功能异常,引起先天性感音神经性耳聋和进行性视网膜色素变性。 | 已明确致病 |
| 常染色体隐性遗传非综合征型耳聋(DFNB12) | CDH23基因突变导致内耳毛细胞静纤毛束异常,引起先天性或早发性听力损失,不伴视网膜病变。 | 已明确致病 |
| 年龄相关性听力损失 | CDH23基因多态性可能增加年龄相关性听力损失的易感性。 | 具有较强研究证据 |
| 噪声性听力损失 | CDH23基因变异可能影响个体对噪声性听力损失的易感性。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 内耳 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达或未检测 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 毛细胞 | 暂无可靠数据 | 内耳毛细胞 |
| 视网膜色素上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 视网膜 |
| 其他细胞系 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.719C>T (p.Pro240Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能受损 |
| c.1234G>A (p.Gly412Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能受损 |
| c.4567delC (p.Leu1523Trpfs*2) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.7891C>T (p.Arg2631*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数CDH23突变导致功能丧失,包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,导致蛋白截短或降解,影响毛细胞静纤毛束的形成和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CDH23突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CDH23突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005509 (calcium ion binding) | • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) |
| • GO:0007605 (sensory perception of sound) | • GO:0007601 (visual perception) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• KEGG: hsa05416 (Viral myocarditis)
• Reactome: R-HSA-202733 (Cell surface interactions at the vascular wall)
• Reactome: R-HSA-1474244 (Extracellular matrix organization)
蛋白质功能简介
CDH23蛋白是一种跨膜钙黏蛋白,包含多个钙黏蛋白重复结构域、一个跨膜区和一个胞内尾。在内耳毛细胞中,CDH23与PCDH15相互作用,形成连接静纤毛的尖端连接,对机械转导至关重要。在视网膜中,CDH23可能参与光感受器突触的维持。蛋白突变导致蛋白功能丧失,影响毛细胞和光感受器的正常功能。