CDHR1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CDHR1基因编码钙黏蛋白相关家族成员1,在视网膜光感受器细胞中高表达,其突变与视网膜色素变性等遗传性视网膜疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 CDHR1
基因全名 Cadherin Related Family Member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q23.1
NCBI Gene ID 92211 ncbi.nlm.nih.gov/gene/92211
Ensembl ID ENSG00000148677
UniProt ID Q96JP9
OMIM ID 609502
HGNC ID 14506
基因别名 CORD15, PCDH21, PRCAD

基因功能与研究简介

CDHR1基因编码钙黏蛋白相关家族成员1,属于钙黏蛋白超家族。该蛋白在视网膜光感受器细胞中高表达,定位于感光细胞外节盘膜,参与光感受器细胞的结构维持和功能。CDHR1突变可导致常染色体隐性遗传性视网膜色素变性(RP)和视锥-视杆细胞营养不良(CORD),是遗传性视网膜疾病的重要致病基因。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 CDHR1基因突变导致光感受器细胞外节盘膜结构异常,引起感光细胞进行性退化,最终导致视力丧失。 已明确致病
视锥-视杆细胞营养不良 CDHR1突变可导致视锥和视杆细胞功能异常,表现为进行性视力下降、色觉异常和视野缺损。 已明确致病
黄斑变性 部分CDHR1突变与年龄相关性黄斑变性(AMD)存在潜在关联,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 低表达
其他组织 暂无可靠数据 极低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
Y79 暂无可靠数据 视网膜母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.783G>A (p.Trp261Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1745delC (p.Pro582LeufsTer19) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.2146C>T (p.Arg716Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

CDHR1基因的致病突变多为功能缺失型突变,导致蛋白截短或降解,破坏光感受器细胞外节盘膜的结构完整性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CDHR1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明CDHR1存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005509 calcium ion binding • GO:0007156 homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• GO:0016021 integral component of membrane • GO:0007601 visual perception
• GO:0001917 photoreceptor inner segment • GO:0001750 photoreceptor outer segment

相关通路

Retinol metabolism (KEGG: hsa00830)
Phototransduction (KEGG: hsa04744)

蛋白质功能简介

CDHR1蛋白属于钙黏蛋白超家族,包含多个钙黏蛋白重复结构域和跨膜区。该蛋白在视网膜光感受器细胞中高表达,定位于感光细胞外节盘膜,参与维持外节盘膜的结构和功能。CDHR1蛋白可能通过钙依赖性同嗜性细胞粘附作用,参与光感受器细胞外节盘膜的形态发生和稳定性维持。

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