CDHR4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
CDHR4编码钙黏蛋白相关家族成员,参与细胞黏附与信号转导,其表达异常与多种肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CDHR4 |
|---|---|
| 基因全名 | Cadherin Related Family Member 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q21.1 |
| NCBI Gene ID | 389118 ncbi.nlm.nih.gov/gene/389118 |
| Ensembl ID | ENSG00000188610 |
| UniProt ID | Q6P9E8 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:33713 |
| 基因别名 | CDH-related family member 4, FLJ46154 |
基因功能与研究简介
CDHR4(Cadherin Related Family Member 4)是钙黏蛋白相关家族成员,编码一种单次跨膜蛋白,含有多个钙黏蛋白结构域,参与细胞间黏附、信号转导及组织形态发生。CDHR4在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中水平较高。研究表明,CDHR4在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞黏附、增殖和迁移参与肿瘤发生发展。此外,CDHR4可能参与Wnt信号通路调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | CDHR4表达下调可能促进肿瘤侵袭和转移,机制涉及细胞黏附减弱和上皮-间质转化(EMT) | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | CDHR4表达降低与肿瘤分期和不良预后相关,可能通过调控β-catenin信号通路影响肿瘤进展 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CDHR4表达异常与肿瘤分级和转移相关,可能通过影响细胞极性及黏附 | 潜在关联 |
| 胃癌 | CDHR4表达下调与肿瘤分化程度及淋巴结转移相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响细胞黏附功能 |
| c.567G>A (p.Trp189Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,可能影响蛋白稳定性 |
| c.890A>G (p.Tyr297Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致蛋白功能丧失或减弱,如无义突变、移码突变等。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):导致蛋白获得新功能或活性增强,目前CDHR4未见明确此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):突变蛋白干扰正常蛋白功能,目前CDHR4未见明确此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005509 (calcium ion binding) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (P00057)
• Cadherin signaling pathway (P00012)
蛋白质功能简介
CDHR4蛋白属于钙黏蛋白超家族,包含多个胞外钙黏蛋白结构域、一个跨膜区和一个胞内尾。该蛋白可能参与钙依赖性细胞间黏附,并在组织形态发生和维持细胞极性中发挥作用。研究表明,CDHR4可能通过与β-catenin相互作用调节Wnt信号通路,从而影响细胞增殖和分化。在肿瘤中,CDHR4表达下调可能促进上皮-间质转化(EMT),增强肿瘤侵袭能力。