CDK5R2基因|基因功能、疾病关联、突变与神经发育研究

CDK5R2编码CDK5的激活亚基p39,在神经元迁移和突触可塑性中发挥关键作用,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 CDK5R2
基因全名 Cyclin Dependent Kinase 5 Regulatory Subunit 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q35
NCBI Gene ID 8941 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8941
Ensembl ID ENSG00000171450
UniProt ID Q13316
OMIM ID 603764
HGNC ID 1776
基因别名 p39, NCK5A2

基因功能与研究简介

CDK5R2(Cyclin Dependent Kinase 5 Regulatory Subunit 2)编码CDK5的激活亚基p39,主要在神经系统中表达。p39与CDK5结合形成活性复合物,参与神经元迁移、突触可塑性、神经递质释放等过程。CDK5R2突变可能导致CDK5活性异常,进而影响神经发育,与某些神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 CDK5R2突变可能影响CDK5活性,导致神经元迁移异常和突触功能缺陷,与神经发育障碍相关。 ClinVar收录有致病性变异,但具体疾病表型尚不明确。
智力障碍 有研究报道CDK5R2突变与智力障碍相关,但证据有限。 ClinVar中收录有疑似致病性变异,但缺乏大规模研究支持。
自闭症谱系障碍 部分研究提示CDK5R2变异可能与自闭症相关,但证据尚不充分。 暂无明确证据,仅有个别病例报道。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 人神经母细胞瘤细胞系
SK-N-SH 暂无可靠数据 人神经母细胞瘤细胞系
其他 暂无可靠数据 暂无明确证据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.457C>T (p.Arg153Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,可能丧失激活CDK5的功能。
c.638G>A (p.Arg213His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或与CDK5的结合,功能影响待验证。
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 可能影响翻译起始,导致蛋白缺失,Loss of Function。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致p39蛋白功能丧失,无法有效激活CDK5,影响神经元迁移和突触功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明CDK5R2突变会导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):突变蛋白可能干扰正常p39与CDK5的结合,但证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005886 plasma membrane • GO:0007420 brain development
• GO:0001764 neuron migration • GO:0048167 regulation of synaptic plasticity

相关通路

CDK5 signaling pathway
Neuronal migration pathway

蛋白质功能简介

CDK5R2编码的p39蛋白是CDK5的激活亚基,主要在脑组织中表达。p39与CDK5结合形成复合物,磷酸化多种底物,参与神经元迁移、突触可塑性、神经递质释放等关键过程。p39的缺失或突变可能导致CDK5活性异常,进而影响神经发育和功能。

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