CDK9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CDK9是转录调控的关键激酶,参与多种癌症和炎症性疾病,是重要的药物靶点。

基因信息卡

基因符号 CDK9
基因全名 cyclin dependent kinase 9
基因类型 protein coding
染色体位置 9q34.3
NCBI Gene ID 1025 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1025
Ensembl ID ENSG00000136859
UniProt ID P50750
OMIM ID 603251
HGNC ID 1780
基因别名 TAT; C-2k; CDC2L4; PITALRE; CTK1

基因功能与研究简介

CDK9(细胞周期蛋白依赖性激酶9)是转录调控中的关键激酶,作为正转录延伸因子b(P-TEFb)的催化亚基,通过磷酸化RNA聚合酶II的C端结构域(CTD)促进转录延伸。CDK9在细胞周期、分化、凋亡等过程中发挥重要作用,其异常表达或活性失调与多种癌症、炎症性疾病及病毒感染相关。CDK9已成为抗肿瘤药物研发的重要靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 CDK9在多种癌症中高表达,通过促进转录延伸支持肿瘤细胞增殖和存活。抑制CDK9可诱导凋亡,是癌症治疗的潜在策略。 较强研究证据
炎症性疾病 CDK9参与调控炎症相关基因的表达,其活性与炎症反应密切相关。 潜在关联
HIV感染 CDK9是HIV Tat蛋白激活转录所必需的,抑制CDK9可抑制病毒复制。 较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
全组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致CDK9激酶活性降低或丧失,可能影响转录调控,但目前在人类疾病中尚无明确致病性突变报道。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:导致CDK9活性增强,可能促进肿瘤发生,但具体突变尚未明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能干扰P-TEFb复合物功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004672 (protein kinase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) • GO:0006368 (transcription elongation from RNA polymerase II promoter)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

P-TEFb pathway (Reactome: R-HSA-112382)
RNA Polymerase II Transcription Elongation (Reactome: R-HSA-75955)
HIV Transcription Initiation (Reactome: R-HSA-167243)

蛋白质功能简介

CDK9蛋白属于细胞周期蛋白依赖性激酶家族,由372个氨基酸组成,分子量约42.9 kDa。其N端包含激酶结构域,C端富含脯氨酸、谷氨酸、丝氨酸和苏氨酸(PEST)序列,参与蛋白稳定性调控。CDK9与细胞周期蛋白T1、T2或K结合形成P-TEFb复合物,通过磷酸化RNA聚合酶II CTD的Ser2残基促进转录延伸。CDK9活性受多种机制调控,包括磷酸化、乙酰化和与HEXIM1/7-7SK snRNP复合物的结合。

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