CDKN1C基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CDKN1C编码细胞周期依赖性激酶抑制因子1C，是调控细胞增殖与分化的重要因子，其突变与多种遗传性疾病及肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CDKN1C |
|---|---|
| 基因全名 | cyclin dependent kinase inhibitor 1C |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.4 |
| NCBI Gene ID | 1028 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1028 |
| Ensembl ID | ENSG00000129757 |
| UniProt ID | P49918 |
| OMIM ID | 600856 |
| HGNC ID | 1786 |
| 基因别名 | BWS, BWCR, IMAGE, KIP2, WBS, p57Kip2 |
基因功能与研究简介
CDKN1C基因编码细胞周期依赖性激酶抑制因子1C（p57Kip2），属于Cip/Kip家族，通过抑制多种细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）的活性，负调控细胞周期进程。该基因在胚胎发育、细胞分化、凋亡及肿瘤抑制中发挥重要作用。CDKN1C的突变或表达异常与Beckwith-Wiedemann综合征（BWS）、IMAGe综合征、Silver-Russell综合征（SRS）以及多种肿瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Beckwith-Wiedemann综合征 | CDKN1C功能缺失突变导致细胞增殖失控，引起过度生长综合征 | 已明确致病 |
| IMAGe综合征 | CDKN1C功能获得性突变导致生长受限、肾上腺发育不全等 | 已明确致病 |
| Silver-Russell综合征 | CDKN1C表达上调或突变可能参与生长迟缓的发病机制 | 具有较强研究证据 |
| 肾上腺皮质癌 | CDKN1C表达下调或突变与肿瘤发生相关 | 癌症相关 |
| 肝母细胞瘤 | CDKN1C表达缺失或突变与肿瘤发生相关 | 癌症相关 |
| 肾母细胞瘤 | CDKN1C表达异常与肿瘤发生相关 | 癌症相关 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.836G>A (p.Arg279Gln) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变，与IMAGe综合征相关 |
| c.820G>A (p.Asp274Asn) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性突变，与IMAGe综合征相关 |
| c.2T>C (p.Met1Thr) | 起始密码子突变 | 罕见 | 功能缺失突变，与Beckwith-Wiedemann综合征相关 |
| c.267_268del (p.Glu90fs) | 移码突变 | 罕见 | 功能缺失突变，与Beckwith-Wiedemann综合征相关 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失突变导致CDKN1C蛋白活性降低或丧失，无法有效抑制CDK活性，导致细胞增殖失控，与Beckwith-Wiedemann综合征及多种肿瘤相关。
Gain of Function（功能获得，GOF）
功能获得性突变增强CDKN1C蛋白的抑制活性，导致细胞周期过度阻滞，影响生长发育，与IMAGe综合征相关。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
显性负性突变可能干扰正常CDKN1C蛋白的功能，但目前在CDKN1C中证据有限，暂无明确证据。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004861 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0007049 (cell cycle) | • GO:0008283 (cell population proliferation) |
| • GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) |
相关通路
• Cell Cycle
• Mitotic (Reactome: R-HSA-69278)
• p53 pathway (KEGG: hsa04115)
• Regulation of cell cycle (KEGG: hsa04110)
蛋白质功能简介
CDKN1C编码的p57Kip2蛋白是细胞周期依赖性激酶抑制剂，属于Cip/Kip家族。该蛋白包含多个功能域，包括N端的CDK抑制域、C端的QT域和PAPA重复序列。p57Kip2通过结合并抑制Cyclin-CDK复合物（如Cyclin E-CDK2和Cyclin A-CDK2）的活性，将细胞阻滞在G1期，从而负调控细胞增殖。此外，p57Kip2还参与细胞分化、凋亡和胚胎发育的调控。其表达受转录因子和表观遗传修饰的调控，在多种组织中表达，尤其在胎盘和肾上腺中高表达。
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