CDKN2B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CDKN2B编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B,是调控细胞周期和肿瘤抑制的关键基因。
基因信息卡
| 基因符号 | CDKN2B |
|---|---|
| 基因全名 | cyclin dependent kinase inhibitor 2B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9p21.3 |
| NCBI Gene ID | 1030 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1030 |
| Ensembl ID | ENSG00000147883 |
| UniProt ID | P42772 |
| OMIM ID | 600431 |
| HGNC ID | 1788 |
| 基因别名 | p15, p15INK4b, MTS2, TP15, INK4B, CDK4I, p15INK4B |
基因功能与研究简介
CDKN2B基因编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(p15INK4b),属于INK4家族。该蛋白通过抑制CDK4和CDK6的活性,调控细胞周期G1期到S期的转换,从而抑制细胞增殖。CDKN2B在多种肿瘤中表达下调或缺失,是重要的肿瘤抑制基因。此外,CDKN2B还参与细胞衰老、凋亡和分化等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性淋巴细胞白血病 | CDKN2B缺失或突变导致细胞周期调控失常,促进白血病发生 | 已明确致病 |
| 黑色素瘤 | CDKN2B缺失或表观遗传沉默与黑色素瘤易感性相关 | 具有较强研究证据 |
| 非小细胞肺癌 | CDKN2B表达下调与肺癌进展相关 | 具有较强研究证据 |
| 胰腺癌 | CDKN2B缺失与胰腺癌发生相关 | 具有较强研究证据 |
| 动脉粥样硬化 | CDKN2B基因变异与动脉粥样硬化风险相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 急性髓系白血病细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 非小细胞肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.150C>A (p.Cys50*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.247_248del (p.Leu83Valfs*2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| 基因缺失 | 大片段缺失 | 常见于肿瘤 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致p15INK4b蛋白表达减少或功能丧失,解除对CDK4/6的抑制,促进细胞增殖。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CDKN2B存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CDKN2B存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004861 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0008283 cell population proliferation |
| • GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation | • GO:0000079 regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity |
相关通路
• Cell Cycle
• Mitotic (Reactome: R-HSA-69278)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
• Cell cycle (KEGG: hsa04110)
• TGF-beta signaling pathway (KEGG: hsa04350)
蛋白质功能简介
CDKN2B编码的p15INK4b蛋白是细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂,特异性抑制CDK4和CDK6的活性。通过结合CDK4/6,阻止其与cyclin D形成复合物,从而抑制Rb蛋白磷酸化,导致细胞周期阻滞在G1期。p15INK4b在TGF-β信号通路中发挥重要作用,介导TGF-β诱导的生长抑制。该蛋白的缺失或功能异常与多种肿瘤的发生发展密切相关。