CDT1基因|DNA复制许可调控、疾病关联、突变与功能研究
CDT1是DNA复制起始的关键调控因子,其异常表达与多种癌症及发育性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CDT1 |
|---|---|
| 基因全名 | Chromatin licensing and DNA replication factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q24.3 |
| NCBI Gene ID | 81620 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81620 |
| Ensembl ID | ENSG00000167513 |
| UniProt ID | Q9H211 |
| OMIM ID | 605525 |
| HGNC ID | 24576 |
| 基因别名 | DUP, RIS2 |
基因功能与研究简介
CDT1(染色质许可和DNA复制因子1)是DNA复制起始的关键调控因子。在细胞周期中,CDT1与CDC6协同作用,促进MCM2-7复合物加载到染色质上,从而形成复制前复合物(pre-RC),确保DNA复制在每个细胞周期中仅发生一次。CDT1的活性受到严格调控,包括与Geminin的结合、泛素化降解以及CDK磷酸化等。CDT1的异常表达或突变可能导致DNA复制失控,与多种癌症和发育性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Meier-Gorlin综合征 | 已明确致病:CDT1突变导致DNA复制许可缺陷,影响细胞增殖,导致骨骼发育异常和矮小等特征。 | OMIM |
| 肝细胞癌 | 具有较强研究证据:CDT1在肝癌中高表达,促进肿瘤细胞增殖,与不良预后相关。 | PMID: 31209454 |
| 结直肠癌 | 具有较强研究证据:CDT1过表达与结直肠癌的发生发展相关,可能作为治疗靶点。 | PMID: 30120215 |
| 乳腺癌 | 潜在关联:CDT1表达异常与乳腺癌细胞增殖和侵袭相关,但机制尚需进一步研究。 | PMID: 29326435 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.244C>T (p.Arg82Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function:导致截短蛋白,丧失功能,与Meier-Gorlin综合征相关。 |
| c.367A>G (p.Thr123Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能,与Meier-Gorlin综合征相关。 |
| c.500G>A (p.Arg167Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响与Geminin的结合,导致DNA复制失控,与癌症相关。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致CDT1蛋白功能丧失或减弱,影响DNA复制许可,导致细胞增殖障碍,与Meier-Gorlin综合征相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明CDT1存在功能获得性突变,但过表达可能具有类似效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据表明CDT1突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003682 chromatin binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0006270 DNA replication initiation | • GO:0006271 DNA strand elongation involved in DNA replication |
| • GO:0031267 small GTPase binding | • GO:0044772 mitotic cell cycle phase transition |
相关通路
• Cell Cycle (KEGG: hsa04110)
• DNA Replication (Reactome: R-HSA-69306)
蛋白质功能简介
CDT1蛋白由546个氨基酸组成,包含一个N端的复制许可结构域和一个C端的Geminin结合结构域。CDT1在细胞核中定位,与CDC6和MCM2-7复合物相互作用,促进复制前复合物的形成。CDT1的活性受到严格调控:在G1期,CDT1与Geminin结合,防止其被泛素化降解;在S期,CDT1被SCF-Skp2复合物泛素化降解,确保DNA复制仅发生一次。CDT1的异常表达或突变可能导致DNA复制过度启动,引起基因组不稳定,与癌症发生相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|