CELF3基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
CELF3是CUGBP Elav样家族成员,参与RNA剪接调控,与神经系统发育和疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CELF3 |
|---|---|
| 基因全名 | CUGBP Elav-like family member 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.3 |
| NCBI Gene ID | 11159 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11159 |
| Ensembl ID | ENSG00000117461 |
| UniProt ID | Q5SZQ8 |
| OMIM ID | 612224 |
| HGNC ID | 1833 |
| 基因别名 | BRUNOL1, CELF-3, TNRC4 |
基因功能与研究简介
CELF3(CUGBP Elav-like family member 3)是CELF家族成员,编码一种RNA结合蛋白,参与mRNA剪接、翻译和稳定性调控。该基因在神经系统发育中发挥重要作用,其异常表达或突变与神经系统疾病相关。CELF3在多种组织中表达,尤其在脑组织中富集。研究表明,CELF3可能参与神经元分化和突触功能调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 暂无明确疾病关联 | 暂无明确致病机制 | 暂无可靠数据 |
| 神经系统发育异常(潜在关联) | CELF3参与RNA剪接调控,可能影响神经元发育相关基因的表达,但具体机制尚不明确。 | 具有较强研究证据(基于功能研究) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA-seq和免疫组化) |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,低表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系,低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确功能影响 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致CELF3蛋白功能丧失,影响RNA剪接调控,但具体疾病关联尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • RNA binding (GO:0003723) | • mRNA binding (GO:0003729) |
| • regulation of alternative mRNA splicing | • via spliceosome (GO:0000381) |
| • mRNA processing (GO:0006397) | • nucleus (GO:0005634) |
| • cytoplasm (GO:0005737) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
CELF3蛋白属于CELF家族,包含两个RNA识别基序(RRM)和一个divergent domain。该蛋白主要定位在细胞核和细胞质,参与mRNA剪接调控,特别是外显子跳跃和可变剪接。CELF3在脑组织中高表达,可能调控神经元特异性基因的剪接,影响神经发育和突触功能。