CELF5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CELF5是CUGBP Elav样家族成员,参与RNA剪接调控,与神经系统发育和疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CELF5 |
|---|---|
| 基因全名 | CUGBP Elav-like family member 5 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.2 |
| NCBI Gene ID | 60680 ncbi.nlm.nih.gov/gene/60680 |
| Ensembl ID | ENSG00000104899 |
| UniProt ID | Q8N6T0 |
| OMIM ID | 612866 |
| HGNC ID | 18490 |
| 基因别名 | BRUNOL5, CELF-5, FLJ12887 |
基因功能与研究简介
CELF5基因编码CUGBP Elav样家族成员5,属于CELF/BRUNOL家族,是一种RNA结合蛋白。该蛋白在细胞核和细胞质中表达,参与前体mRNA的剪接调控,影响基因表达。CELF5在神经系统中高表达,对神经元发育和功能至关重要。研究表明,CELF5可能参与神经发育障碍和癌症的发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 自闭症谱系障碍 | CELF5表达异常可能影响神经元剪接,与自闭症相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 精神分裂症 | CELF5在脑组织中表达,可能参与精神分裂症的病理过程,但证据有限。 | 潜在关联 |
| 癌症 | CELF5在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控癌基因剪接影响肿瘤发生,但具体机制待研究。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合功能 |
| c.567C>T (p.Pro189Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.890_891insA (p.Thr297fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致CELF5蛋白功能丧失或降低,可能影响RNA剪接调控,与神经发育异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明CELF5突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明CELF5突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • RNA binding (GO:0003723) | • mRNA binding (GO:0003729) |
| • nucleus (GO:0005634) | • cytoplasm (GO:0005737) |
| • regulation of alternative mRNA splicing | • via spliceosome (GO:0000381) |
| • mRNA processing (GO:0006397) |
相关通路
• mRNA Splicing - Major Pathway (R-HSA-72163)
• Regulation of mRNA Stability by Proteins that Bind AU-rich Elements (R-HSA-450531)
蛋白质功能简介
CELF5蛋白属于CELF家族,包含三个RNA识别基序(RRM),能够结合RNA并调控剪接。该蛋白在神经系统中高表达,参与神经元特异性基因的剪接调控,对神经发育和突触功能至关重要。CELF5的异常表达或突变可能导致RNA剪接失调,进而引发神经发育障碍或癌症。