CFC1基因|基因功能、疾病关联、突变与功能研究
CFC1基因编码的cripto家族蛋白在胚胎发育中发挥关键作用,其突变与人类先天性心脏病(如右心室双出口)密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CFC1 |
|---|---|
| 基因全名 | cripto, FRL-1, cryptic family 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q21.1 |
| NCBI Gene ID | 55997 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55997 |
| Ensembl ID | ENSG00000169093 |
| UniProt ID | P0C7T9 |
| OMIM ID | 605194 |
| HGNC ID | 18292 |
| 基因别名 | CRYPTO, CFC1A, DORV, HTX2 |
基因功能与研究简介
CFC1基因编码cripto家族蛋白,属于EGF-CFC家族成员。该蛋白在胚胎发育中作为Nodal信号通路的共受体,参与左右轴模式形成和心脏发育。CFC1基因突变可导致人类先天性心脏病,如右心室双出口(DORV)和内脏异位(heterotaxy)。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 右心室双出口 | CFC1基因突变导致Nodal信号通路受损,影响心脏流出道发育,导致右心室双出口。 | 已明确致病 |
| 内脏异位 | CFC1基因突变可导致左右轴模式形成异常,引起内脏异位。 | 已明确致病 |
| 法洛四联症 | 部分CFC1突变与法洛四联症相关,但证据较弱。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 胚胎期高表达,成人低表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 胚胎期有表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 有表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| H9人胚胎干细胞 | 暂无可靠数据 | 未分化状态表达 |
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.358G>A (p.Gly120Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与DORV相关 |
| c.507_508del (p.Gly170Alafs*43) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能影响翻译起始,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
CFC1基因突变导致蛋白功能丧失,影响Nodal信号通路,导致发育缺陷。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CFC1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CFC1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005102 (signaling receptor binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0009986 (cell surface) |
| • GO:0007165 (signal transduction) | • GO:0001701 (in utero embryonic development) |
| • GO:0001944 (vasculature development) | • GO:0003148 (outflow tract septum morphogenesis) |
| • GO:0007368 (determination of left/right symmetry) |
相关通路
• Nodal signaling pathway (Reactome: R-HSA-982670)
• Signaling by NODAL (Reactome: R-HSA-982670)
蛋白质功能简介
CFC1蛋白是EGF-CFC家族成员,作为Nodal信号通路的共受体,与Nodal配体和Activin受体结合,激活SMAD2/3信号通路。该蛋白在胚胎发育中至关重要,特别是在左右轴模式形成和心脏发育中。
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