CGN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CGN(Cingulin)是编码紧密连接蛋白cingulin的基因,参与上皮屏障功能调控,与炎症性肠病等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CGN |
|---|---|
| 基因全名 | cingulin |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.3 |
| NCBI Gene ID | 10252 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10252 |
| Ensembl ID | ENSG00000143365 |
| UniProt ID | Q9P2M7 |
| OMIM ID | 606726 |
| HGNC ID | 17456 |
| 基因别名 | Cingulin, CGL, CGNL1 |
基因功能与研究简介
CGN基因编码cingulin蛋白,是紧密连接(tight junction)的组成成分,主要在上皮细胞中表达。Cingulin通过连接紧密连接蛋白(如occludin、claudins)和肌动蛋白细胞骨架,参与调控细胞旁通透性和上皮屏障功能。此外,cingulin还参与细胞信号传导和基因表达调控。CGN基因突变或表达异常与多种疾病相关,包括炎症性肠病、癌症等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 炎症性肠病 | CGN基因变异可能影响紧密连接完整性,导致肠道屏障功能障碍,增加炎症性肠病风险。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | CGN表达下调与结直肠癌的进展和不良预后相关,可能通过影响细胞极性和屏障功能。 | 癌症相关 |
| 胃癌 | CGN表达异常与胃癌的发生发展有关,可能参与上皮间质转化(EMT)。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结肠腺癌细胞系,常用于肠道屏障研究 |
| MDCK | 暂无可靠数据 | 犬肾上皮细胞系,常用于紧密连接研究 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响紧密连接功能 |
| c.456_457insA (p.Gly153fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响紧密连接功能 |
| c.789G>A (p.Val263Ile) | 错义突变 | 低频 | 可能影响蛋白结构,功能影响尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致cingulin蛋白功能丧失或减弱,可能破坏紧密连接结构,增加屏障通透性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明CGN存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):可能干扰正常cingulin蛋白的功能,但暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005911 cell-cell junction | • GO:0005923 bicellular tight junction |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005886 plasma membrane |
相关通路
• Tight junction (KEGG: hsa04530)
• Adherens junction (KEGG: hsa04520)
蛋白质功能简介
Cingulin(CGN)是一种分子量约140 kDa的蛋白质,主要定位于上皮细胞紧密连接处。其N端含有球状结构域,C端含有卷曲螺旋结构域,能够与多种紧密连接蛋白(如ZO-1、occludin)和肌动蛋白相互作用。Cingulin在维持细胞极性、调控细胞旁通透性和细胞增殖中发挥重要作用。此外,cingulin还参与RhoA信号通路的调控,影响细胞骨架重排。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| CGN基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ12901 | 人 | 57530 | 详情 立即询价 |
| CGNL1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ10282 | 人 | 84952 | 详情 立即询价 |
| CGNL1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ37540 | 人 | 84952 | 详情 立即询价 |
| CGN基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ42082 | 人 | 57530 | 详情 立即询价 |
| CGNL1基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ37539 | 人 | 84952 | 详情 立即询价 |
| CGN基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ40834 | 人 | 57530 | 详情 立即询价 |
| CGN基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ42083 | 人 | 57530 | 详情 立即询价 |
| SCGN基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ72377 | 人 | 10590 | 详情 立即询价 |
| SCGN基因敲除A549细胞 | EDJ-KQ63919 | 人 | 10590 | 详情 立即询价 |
| SCGN基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ50990 | 人 | 10590 | 详情 立即询价 |
| SCGN基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ55439 | 人 | 10590 | 详情 立即询价 |
| CGNL1基因敲除Hela细胞 | EDJ-KQ57685 | 人 | 84952 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 12 Of 12 Records