CGREF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CGREF1(Cell Growth Regulator with EF-hand Domain 1)是一种含有EF-hand结构域的细胞生长调控蛋白,参与细胞周期调控和凋亡,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CGREF1 |
|---|---|
| 基因全名 | Cell Growth Regulator with EF-hand Domain 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2p23.3 |
| NCBI Gene ID | 10669 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10669 |
| Ensembl ID | ENSG00000115159 |
| UniProt ID | Q99674 |
| OMIM ID | 606295 |
| HGNC ID | 17916 |
| 基因别名 | C2orf4, CGR11, DKFZp686H1720 |
基因功能与研究简介
CGREF1基因编码一种含有EF-hand结构域的蛋白质,该蛋白定位于内质网,参与细胞生长调控。研究表明CGREF1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤发生发展。此外,CGREF1还参与内质网应激反应和钙离子信号传导。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | CGREF1在结直肠癌中表达下调,可能通过抑制细胞增殖和促进凋亡发挥抑癌作用。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | CGREF1在肝癌组织中表达降低,与肿瘤分期和预后相关,可能作为抑癌基因。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | CGREF1在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | CGREF1在非小细胞肺癌中表达下调,与不良预后相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.412C>T (p.Arg138Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白质截短,可能引起功能丧失 |
| c.536A>G (p.Asp179Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响EF-hand结构域功能,导致蛋白稳定性改变 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变和移码突变可能导致CGREF1蛋白功能丧失,从而影响细胞生长调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005509 (calcium ion binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0007049 (cell cycle) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• hsa04115 (p53 signaling pathway)
• hsa04210 (Apoptosis)
蛋白质功能简介
CGREF1蛋白含有两个EF-hand结构域,定位于内质网,参与钙离子结合和细胞生长调控。研究表明CGREF1可能通过调节细胞周期和凋亡来抑制肿瘤生长,其表达下调与多种癌症的不良预后相关。