CHAF1A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHAF1A是染色质组装因子1的p150亚基,在DNA复制偶联的核小体组装中发挥关键作用,其突变与多种发育性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 CHAF1A
基因全名 chromatin assembly factor 1 subunit A
基因类型 protein coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 10036 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10036
Ensembl ID ENSG00000167670
UniProt ID Q14432
OMIM ID 601246
HGNC ID 1911
基因别名 CAF-1 p150; CAF1A; CAF1P150; P150

基因功能与研究简介

CHAF1A基因编码染色质组装因子1(CAF-1)的p150亚基,是CAF-1复合物的核心成分。CAF-1在DNA复制偶联的核小体组装中起关键作用,负责将组蛋白H3/H4沉积到新合成的DNA上,从而维持染色质结构和基因组稳定性。CHAF1A还参与DNA损伤修复、细胞周期调控和基因表达调控。CHAF1A功能异常与多种疾病相关,包括发育障碍、智力障碍和多种癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
发育性癫痫性脑病 CHAF1A基因突变导致CAF-1功能受损,影响神经发育,可能通过改变染色质结构和基因表达调控致病。 ClinVar, OMIM
智力障碍 CHAF1A突变与常染色体显性遗传的智力障碍相关,可能通过影响神经元基因表达和突触可塑性。 ClinVar, OMIM
小头畸形 CHAF1A突变可导致小头畸形,可能与神经祖细胞增殖和分化异常有关。 ClinVar
乳腺癌 CHAF1A在乳腺癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和基因组不稳定参与肿瘤发生。 COSMIC, 文献
肺癌 CHAF1A在肺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和DNA修复促进肿瘤进展。 COSMIC, 文献
结直肠癌 CHAF1A在结直肠癌中表达异常,可能影响肿瘤细胞增殖和凋亡。 COSMIC, 文献

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2146C>T (p.Arg716Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1483C>T (p.Arg495Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1096C>T (p.Arg366Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.742C>T (p.Arg248Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致CHAF1A蛋白功能丧失或降低,影响核小体组装和基因组稳定性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CHAF1A存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能具有显性负效应,干扰CAF-1复合物的正常功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006334 nucleosome assembly • GO:0003682 chromatin binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006281 DNA repair
• GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus • GO:0006333 chromatin assembly or disassembly

相关通路

DNA replication
Chromatin organization
DNA damage response

蛋白质功能简介

CHAF1A蛋白是染色质组装因子1(CAF-1)的p150亚基,与p60(CHAF1B)和p48(RBBP4)形成三聚体复合物。CAF-1在DNA复制和修复过程中将组蛋白H3/H4沉积到新合成的DNA上,促进核小体组装。CHAF1A还参与异染色质形成、基因沉默和细胞周期调控。其功能异常与基因组不稳定和多种疾病相关。

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