CHAF1B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHAF1B编码染色质组装因子1的p60亚基,在DNA复制偶联的核小体组装中发挥关键作用,其异常表达与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 CHAF1B
基因全名 chromatin assembly factor 1 subunit B
基因类型 protein coding
染色体位置 21q22.13
NCBI Gene ID 8208 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8208
Ensembl ID ENSG00000159259
UniProt ID Q13112
OMIM ID 601245
HGNC ID 1915
基因别名 CAF-1 p60, CAF1P60, CAF1A, MGC71229

基因功能与研究简介

CHAF1B(chromatin assembly factor 1 subunit B)编码染色质组装因子1(CAF-1)的p60亚基。CAF-1是一个三聚体复合物,由p150(CHAF1A)、p60(CHAF1B)和p48(RBBP4)组成,在DNA复制偶联的核小体组装中起关键作用。CHAF1B通过其WD40重复结构域与p150亚基和组蛋白H3/H4相互作用,促进新合成的组蛋白沉积到新复制的DNA上,从而维持染色质结构和基因组稳定性。CHAF1B在增殖细胞中高表达,其表达水平与细胞增殖状态密切相关。研究表明,CHAF1B在多种癌症中过表达,并与肿瘤进展和不良预后相关。此外,CHAF1B还参与DNA损伤修复和细胞周期调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) CHAF1B在多种癌症中过表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生发展。 较强研究证据
肝细胞癌 CHAF1B高表达与肝细胞癌的恶性进展和不良预后相关。 较强研究证据
乳腺癌 CHAF1B在乳腺癌中表达上调,可能作为致癌基因发挥作用。 较强研究证据
结直肠癌 CHAF1B表达水平与结直肠癌的进展和转移相关。 较强研究证据
肺癌 CHAF1B在非小细胞肺癌中高表达,与肿瘤分期和预后相关。 较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达(基于GTEx)
骨髓 暂无可靠数据 高表达(基于GTEx)
脾脏 暂无可靠数据 中等表达(基于GTEx)
胸腺 暂无可靠数据 中等表达(基于GTEx)
淋巴结 暂无可靠数据 中等表达(基于GTEx)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系,CHAF1B高表达
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系,CHAF1B高表达
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系,CHAF1B中等表达
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系,CHAF1B中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1054C>T (p.Arg352Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确
c.163G>A (p.Gly55Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确
c.742C>T (p.Arg248Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致CAF-1复合物组装异常,影响DNA复制偶联的核小体组装,导致基因组不稳定。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强CHAF1B的致癌活性,促进细胞增殖和肿瘤进展。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰CAF-1复合物的正常功能,导致染色质组装缺陷。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006334 nucleosome assembly • GO:0005634 nucleus
• GO:0005515 protein binding • GO:0003682 chromatin binding
• GO:0006281 DNA repair • GO:0007049 cell cycle

相关通路

DNA replication
Chromatin organization
Cell cycle

蛋白质功能简介

CHAF1B蛋白是染色质组装因子1(CAF-1)复合物的p60亚基,包含WD40重复结构域,介导蛋白质-蛋白质相互作用。该蛋白在DNA复制偶联的核小体组装中起关键作用,通过结合组蛋白H3/H4并促进其沉积到新复制的DNA上,维持染色质结构和基因组稳定性。CHAF1B在增殖细胞中高表达,参与细胞周期调控和DNA损伤修复。其异常表达与多种癌症的发生发展相关。

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