CHERP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CHERP基因编码一种参与RNA剪接和钙信号调控的核蛋白,其功能异常与多种癌症和神经系统疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CHERP |
|---|---|
| 基因全名 | Calcium Homeostasis Endoplasmic Reticulum Protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.11 |
| NCBI Gene ID | 10523 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10523 |
| Ensembl ID | ENSG00000105664 |
| UniProt ID | Q8IWX8 |
| OMIM ID | 617106 |
| HGNC ID | 16930 |
| 基因别名 | SCAF6, DAN16, FLJ10156 |
基因功能与研究简介
CHERP基因编码一种核蛋白,参与RNA剪接和钙信号调控。该蛋白与核内剪接因子相互作用,调节前体mRNA的剪接过程,并参与内质网钙稳态的维持。CHERP基因突变或表达异常与多种疾病相关,包括癌症和神经系统疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | CHERP基因突变或表达异常可能影响细胞增殖和凋亡,与多种癌症相关,但具体机制尚在研究中。 | 具有较强研究证据 |
| 神经系统疾病 | CHERP基因突变可能影响神经元功能,与某些神经系统疾病相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567delC (p.Leu189fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变可能导致蛋白截短,功能丧失,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CHERP基因存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CHERP基因存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000398 (mRNA splicing | • via spliceosome) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
相关通路
• hsa03040 (Spliceosome)
• hsa04020 (Calcium signaling pathway)
蛋白质功能简介
CHERP蛋白是一种核蛋白,含有多个RNA结合域,参与前体mRNA的剪接过程。它还与内质网钙通道相互作用,调节钙稳态。CHERP蛋白在多种组织中表达,其功能异常可能导致细胞凋亡和增殖失衡。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|