CHERP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHERP基因编码一种参与RNA剪接和钙信号调控的核蛋白,其功能异常与多种癌症和神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 CHERP
基因全名 Calcium Homeostasis Endoplasmic Reticulum Protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.11
NCBI Gene ID 10523 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10523
Ensembl ID ENSG00000105664
UniProt ID Q8IWX8
OMIM ID 617106
HGNC ID 16930
基因别名 SCAF6, DAN16, FLJ10156

基因功能与研究简介

CHERP基因编码一种核蛋白,参与RNA剪接和钙信号调控。该蛋白与核内剪接因子相互作用,调节前体mRNA的剪接过程,并参与内质网钙稳态的维持。CHERP基因突变或表达异常与多种疾病相关,包括癌症和神经系统疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 CHERP基因突变或表达异常可能影响细胞增殖和凋亡,与多种癌症相关,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据
神经系统疾病 CHERP基因突变可能影响神经元功能,与某些神经系统疾病相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HepG2 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变可能导致蛋白截短,功能丧失,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CHERP基因存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明CHERP基因存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa04020 (Calcium signaling pathway)

蛋白质功能简介

CHERP蛋白是一种核蛋白,含有多个RNA结合域,参与前体mRNA的剪接过程。它还与内质网钙通道相互作用,调节钙稳态。CHERP蛋白在多种组织中表达,其功能异常可能导致细胞凋亡和增殖失衡。

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