CHM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHM基因编码Rab escort protein 1,参与Rab蛋白的异戊二烯化修饰,其突变导致无脉络膜症(Choroideremia)。

基因信息卡

基因符号 CHM
基因全名 CHM Rab escort protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xq21.2
NCBI Gene ID 1121 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1121
Ensembl ID ENSG00000188419
UniProt ID P24386
OMIM ID 303100
HGNC ID 1940
基因别名 ['REP-1', 'TCD', 'GGT1']

基因功能与研究简介

CHM基因编码Rab escort protein 1(REP-1),是Rab蛋白异戊二烯化修饰的关键辅助因子。REP-1与Rab蛋白结合,将其呈递给Rab geranylgeranyltransferase(GGTase II),促进Rab蛋白的香叶基香叶基化修饰,从而调控细胞内囊泡运输和膜 trafficking。CHM基因突变导致无脉络膜症(Choroideremia),一种X连锁隐性遗传的视网膜退行性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
无脉络膜症(Choroideremia) CHM基因功能缺失突变导致REP-1蛋白功能丧失,影响Rab蛋白的异戊二烯化,进而导致视网膜色素上皮和脉络膜血管进行性萎缩,最终导致失明。 已明确致病
癌症相关 有研究报道CHM在多种肿瘤中表达异常,但证据尚不充分,暂无明确证据。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.940C>T (p.Arg314Ter) 无义突变 未知 Loss of Function
c.879+1G>A 剪接突变 未知 Loss of Function
c.499del (p.Val167TrpfsTer28) 移码突变 未知 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

CHM基因的致病突变多为功能缺失型,导致REP-1蛋白功能丧失,影响Rab蛋白的异戊二烯化,进而破坏细胞内囊泡运输。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CHM存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明CHM突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004659 prenyltransferase activity • GO:0005515 protein binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006886 intracellular protein transport
• GO:0018342 protein prenylation

相关通路

Rab geranylgeranylation (Reactome: R-HSA-8873719)
Vesicle-mediated transport (Reactome: R-HSA-5653656)

蛋白质功能简介

CHM编码的REP-1蛋白由653个氨基酸组成,分子量约75 kDa。REP-1包含两个结构域:N端的Rab结合域和C端的GGTase II结合域。REP-1与Rab蛋白结合后,将其呈递给GGTase II,催化Rab蛋白C端的半胱氨酸残基进行香叶基香叶基化修饰。该修饰对于Rab蛋白的膜锚定和功能至关重要。REP-1在视网膜色素上皮细胞中高表达,其功能缺失导致Rab蛋白无法正确修饰,进而影响视网膜细胞的囊泡运输和存活。

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