CHML基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CHML基因编码Rab escort protein 2，参与Rab蛋白的异戊二烯化修饰，对细胞内囊泡运输和信号转导至关重要。
基因信息卡
| 基因符号 | CHML |
|---|---|
| 基因全名 | choroideremia-like (Rab escort protein 2) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q43 |
| NCBI Gene ID | 1122 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1122 |
| Ensembl ID | ENSG00000116285 |
| UniProt ID | P26374 |
| OMIM ID | 118825 |
| HGNC ID | 1940 |
| 基因别名 | REP-2, REP2 |
基因功能与研究简介
CHML基因编码Rab escort protein 2（REP-2），是Rab蛋白异戊二烯化修饰的关键辅助因子。REP-2与Rab蛋白结合，将其呈递给Rab geranylgeranyltransferase（GGTase II），促进Rab蛋白的香叶基香叶基化修饰，从而调控细胞内囊泡运输、膜 trafficking 和信号转导。CHML基因突变与无脉络膜症（choroideremia）相关，但CHML本身突变导致的疾病表型较为罕见。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 无脉络膜症（Choroideremia） | CHML基因突变可能导致Rab蛋白修饰异常，影响视网膜色素上皮细胞和脉络膜的功能，但CHML突变引起的无脉络膜症较为罕见，且证据有限。 | ClinVar, OMIM |
| 癌症 | CHML在多种癌症中表达异常，可能参与肿瘤发生发展，但具体机制尚不明确。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.940C>T (p.Arg314Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白质截短，可能丧失功能 |
| c.1186G>A (p.Gly396Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质功能，但证据有限 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
CHML基因的截短突变可能导致功能丧失，影响Rab蛋白修饰，进而干扰囊泡运输。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005794 Golgi apparatus | • GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport |
| • Golgi to ER | • GO:0018343 protein farnesylation |
| • GO:0018344 protein geranylgeranylation |
相关通路
• Rab geranylgeranylation (Reactome: R-HSA-8873719)
• Vesicle-mediated transport (Reactome: R-HSA-5653656)
蛋白质功能简介
CHML编码的REP-2蛋白由653个氨基酸组成，分子量约74 kDa。REP-2包含两个结构域：N端的Rab结合域和C端的GGTase II结合域。REP-2与REP-1（由CHM基因编码）功能相似，但组织表达分布不同。REP-2在多种组织中表达，尤其在睾丸和视网膜中丰富。REP-2与Rab蛋白结合，将其呈递给GGTase II，催化Rab蛋白的异戊二烯化修饰，这对于Rab蛋白的膜锚定和功能至关重要。
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