CHMP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHMP3是ESCRT-III复合物的核心组分,参与多泡体形成、膜分裂及病毒出芽,其突变与神经退行性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 CHMP3
基因全名 charged multivesicular body protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p23.3
NCBI Gene ID 51652 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51652
Ensembl ID ENSG00000115561
UniProt ID Q9Y3E1
OMIM ID 609272
HGNC ID 29875
基因别名 NEDF; VPS24; CGI-149

基因功能与研究简介

CHMP3(charged multivesicular body protein 3)是ESCRT-III复合物的核心亚基,参与多泡体(MVB)形成、膜分裂、细胞分裂、病毒出芽等过程。CHMP3通过调控膜重塑和蛋白质分选,在细胞稳态中发挥关键作用。其功能异常与神经退行性疾病(如肌萎缩侧索硬化)和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肌萎缩侧索硬化(ALS) CHMP3突变可能影响ESCRT-III功能,导致神经元内蛋白质聚集和毒性,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据
癌症 CHMP3在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞增殖、凋亡和自噬参与肿瘤发生,但具体作用需进一步验证。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.496C>T (p.Arg166Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与ALS相关
c.113A>G (p.Glu38Gly) 错义突变 罕见 可能影响ESCRT-III功能,与神经退行性疾病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致CHMP3蛋白功能丧失或减弱,影响ESCRT-III复合物的正常组装和功能,可能导致膜分裂和蛋白质分选异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明CHMP3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白可能干扰正常CHMP3蛋白的功能,影响ESCRT-III复合物的形成,但具体证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005768 endosome
• GO:0005770 late endosome • GO:0005829 cytosol
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0016197 endosomal transport
• GO:0032509 endosome organization • GO:0043162 ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway

相关通路

ESCRT pathway (Reactome: R-HSA-162599)
Endosomal Sorting Complex Required for Transport (ESCRT) (KEGG: hsa04144)

蛋白质功能简介

CHMP3蛋白是ESCRT-III复合物的核心亚基,由222个氨基酸组成,分子量约25 kDa。该蛋白包含一个N端基本结构域和一个C端螺旋结构域,能够与其他ESCRT-III亚基相互作用,形成螺旋丝状结构,参与膜分裂和囊泡形成。CHMP3在细胞质中可溶性存在,在膜重塑过程中被招募到内体膜上。其功能异常与神经退行性疾病和癌症相关。

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