CHODL基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱

CHODL(Chondrolectin)是一种在骨骼肌和运动神经元中高表达的跨膜蛋白,参与肌肉发育和神经肌肉接头形成,其突变可能与肌萎缩侧索硬化等神经肌肉疾病相关。

基因信息卡

基因符号 CHODL
基因全名 chondrolectin
基因类型 protein-coding
染色体位置 21q11.2
NCBI Gene ID 140578 ncbi.nlm.nih.gov/gene/140578
Ensembl ID ENSG00000160255
UniProt ID Q9H9P2
OMIM ID 607773
HGNC ID 17807
基因别名 MT-65, UNQ1912/PRO4357, C21orf68

基因功能与研究简介

CHODL(Chondrolectin)基因编码一种I型跨膜蛋白,属于C型凝集素家族。该蛋白在骨骼肌、心脏和运动神经元中高表达,参与肌肉发育、神经肌肉接头形成以及细胞黏附过程。CHODL在斑马鱼中的同源基因已被证实对运动神经元的轴突生长至关重要,但在人类中的功能研究相对有限。目前,CHODL的突变与肌萎缩侧索硬化(ALS)等神经肌肉疾病的关联正在研究中,但尚未有明确的致病性突变被广泛确认。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肌萎缩侧索硬化 潜在关联:CHODL在运动神经元中表达,可能参与轴突生长和维持,其功能异常可能影响运动神经元存活,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据,仅有少量研究提示关联
2型糖尿病 潜在关联:CHODL在胰岛中表达,可能参与胰岛素分泌或β细胞功能,但证据有限。 暂无明确证据,仅有表达数据支持

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序和免疫组化)
心脏 暂无可靠数据 中等表达
脊髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
骨骼肌细胞 暂无可靠数据 高表达
运动神经元 暂无可靠数据 高表达
胰岛β细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.456G>A (p.Trp152Ter) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变可能导致蛋白截短或降解,从而丧失正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无证据表明CHODL突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前尚无证据表明CHODL突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0005529 (sugar binding)

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

CHODL蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含一个C型凝集素结构域,可能参与碳水化合物结合和细胞黏附。在骨骼肌和运动神经元中高表达,提示其在神经肌肉系统中的重要作用。斑马鱼研究表明CHODL对运动神经元轴突生长至关重要,但在人类中的功能仍需进一步研究。

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