CHST6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CHST6编码角膜N-乙酰葡糖胺-6-磺基转移酶,其突变导致角膜内皮营养不良,是角膜疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | CHST6 |
|---|---|
| 基因全名 | carbohydrate sulfotransferase 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q22.2 |
| NCBI Gene ID | 4166 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4166 |
| Ensembl ID | ENSG00000183196 |
| UniProt ID | Q9GZX3 |
| OMIM ID | 605294 |
| HGNC ID | 1966 |
| 基因别名 | GLCN6ST, KSGal6ST, hCG6ST |
基因功能与研究简介
CHST6基因编码N-乙酰葡糖胺-6-磺基转移酶,该酶催化硫酸基团转移至N-乙酰葡糖胺的6位,参与角膜中硫酸角质素的生物合成。硫酸角质素是角膜透明性的重要成分,其合成异常导致角膜混浊。CHST6突变是角膜内皮营养不良(MCD)的主要致病原因,MCD是一种常染色体隐性遗传病,表现为角膜进行性混浊,导致视力障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 角膜内皮营养不良(MCD) | CHST6突变导致酶活性丧失,硫酸角质素合成受阻,角膜基质中硫酸角质素含量降低,引起角膜混浊。 | 已明确致病 |
| 角膜内皮营养不良(MCD) | CHST6突变导致酶活性丧失,硫酸角质素合成受阻,角膜基质中硫酸角质素含量降低,引起角膜混浊。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 角膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 角膜上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 角膜基质细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 常见 | Loss of Function |
| c.484G>A (p.Gly162Ser) | 错义突变 | 少见 | Loss of Function |
| c.742C>T (p.Arg248Ter) | 无义突变 | 少见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
CHST6突变导致酶活性丧失或降低,影响硫酸角质素的合成,是MCD的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明CHST6存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CHST6存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0001517 (N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase activity) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0006024 (glycosaminoglycan biosynthetic process) |
相关通路
• Keratan sulfate biosynthesis (Reactome: R-HSA-2022857)
蛋白质功能简介
CHST6蛋白是高尔基体中的II型膜蛋白,催化硫酸基团从3'-磷酸腺苷-5'-磷酸硫酸(PAPS)转移至N-乙酰葡糖胺的6位,参与硫酸角质素的合成。该蛋白在角膜中高表达,对维持角膜透明性至关重要。