CHSY3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CHSY3编码软骨素合酶3,参与糖胺聚糖合成,与骨骼发育及多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 CHSY3
基因全名 chondroitin sulfate synthase 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q23.3
NCBI Gene ID 337876 ncbi.nlm.nih.gov/gene/337876
Ensembl ID ENSG00000198160
UniProt ID Q70JQ9
OMIM ID 610138
HGNC ID 20684
基因别名 CHSY-3, ChSy-3, CSS3, DKFZp686H1720

基因功能与研究简介

CHSY3基因编码软骨素合酶3,是糖胺聚糖合成途径中的关键酶,参与软骨素硫酸盐的合成。该基因在骨骼发育、结缔组织形成中发挥重要作用。CHSY3突变与多种骨骼发育异常和结缔组织疾病相关,如脊柱骨骺发育不良和骨关节炎。此外,CHSY3在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脊柱骨骺发育不良 CHSY3突变导致软骨素合成缺陷,影响骨骼发育 已明确致病
骨关节炎 CHSY3表达下调导致软骨基质合成减少,促进关节退变 较强研究证据
结缔组织疾病 CHSY3功能异常影响胶原纤维形成,导致结缔组织异常 潜在关联
癌症 CHSY3在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响肿瘤微环境促进进展 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
软骨 暂无可靠数据 高表达
骨骼 暂无可靠数据 中等表达
皮肤 暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
软骨细胞 暂无可靠数据 高表达
成骨细胞 暂无可靠数据 中等表达
成纤维细胞 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.456_457del (p.Glu153fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致CHSY3蛋白活性降低或丧失,影响软骨素合成,导致骨骼发育异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明CHSY3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明CHSY3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008373 - sialyltransferase activity • GO:0005975 - carbohydrate metabolic process
• GO:0015016 - chondroitin sulfate biosynthetic process • GO:0005794 - Golgi apparatus

相关通路

Chondroitin sulfate biosynthesis (Reactome: R-HSA-1971475)
Glycosaminoglycan metabolism (KEGG: hsa00532)

蛋白质功能简介

CHSY3蛋白是软骨素合酶家族成员,定位于高尔基体,参与软骨素硫酸盐链的延伸。该蛋白具有糖基转移酶活性,催化N-乙酰半乳糖胺和葡萄糖醛酸的交替添加。CHSY3在软骨和骨骼组织中高表达,对骨骼发育至关重要。

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