CITED2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CITED2是心脏发育和应激反应中的关键转录共激活因子,其突变与先天性心脏病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CITED2 |
|---|---|
| 基因全名 | Cbp/p300-interacting transactivator with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q24.1 |
| NCBI Gene ID | 10370 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10370 |
| Ensembl ID | ENSG00000164442 |
| UniProt ID | Q99967 |
| OMIM ID | 602937 |
| HGNC ID | 1987 |
| 基因别名 | MRG1, p35srj, P35SRJ |
基因功能与研究简介
CITED2基因编码一种转录共激活因子,通过结合CBP/p300等转录共激活因子,调控多种基因的表达。CITED2在胚胎发育中发挥重要作用,尤其是在心脏发育、神经管形成和肾上腺发育中。此外,CITED2还参与细胞应激反应、细胞增殖和凋亡的调控。CITED2的异常表达或突变与先天性心脏病、某些癌症(如白血病、肺癌)以及肾上腺发育异常相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性心脏病 | CITED2突变导致其功能丧失,影响心脏发育相关基因的表达,导致心脏畸形。 | 已明确致病 |
| 室间隔缺损 | CITED2突变与室间隔缺损相关,可能通过影响心脏发育中的信号通路。 | 已明确致病 |
| 法洛四联症 | CITED2突变与法洛四联症相关,可能通过影响心脏流出道发育。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | CITED2在白血病中高表达,可能通过促进白血病细胞增殖和存活。 | 癌症相关 |
| 肺癌 | CITED2在肺癌中表达上调,可能通过促进肿瘤生长和转移。 | 癌症相关 |
| 肾上腺发育异常 | CITED2突变可能导致肾上腺发育不全,影响皮质醇合成。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| H9c2(大鼠心肌细胞) | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| A549(人肺癌细胞) | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| K562(人白血病细胞) | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| HEK293(人胚肾细胞) | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.499C>T (p.Arg167Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.574G>A (p.Gly192Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.IVS2+1G>A | 剪接位点突变 | 罕见 | 可能影响mRNA剪接 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
CITED2功能丧失突变导致其编码蛋白无法正常发挥转录共激活功能,影响下游基因表达,与先天性心脏病和肾上腺发育异常相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明CITED2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前尚无明确证据表明CITED2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003713 (transcription coactivator activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| • GO:0007507 (heart development) | • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• hsa05200 (Pathways in cancer)
• hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
• hsa05410 (Hypertrophic cardiomyopathy)
• hsa05414 (Dilated cardiomyopathy)
蛋白质功能简介
CITED2蛋白由270个氨基酸组成,包含一个保守的CITED结构域,该结构域介导与CBP/p300的相互作用。CITED2通过结合CBP/p300,增强转录因子(如HIF-1α)的活性,从而调控靶基因表达。在心脏发育中,CITED2通过调节Nodal信号通路和心脏转录因子(如NKX2-5)的表达,促进心脏形态发生。在细胞应激反应中,CITED2可抑制HIF-1α的转录活性,参与缺氧应答的调控。此外,CITED2还参与细胞周期调控和凋亡,其异常表达与肿瘤发生相关。