CITED4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CITED4是CITED家族成员,参与转录调控和细胞增殖,与多种癌症及发育过程相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CITED4 |
|---|---|
| 基因全名 | Cbp/p300-interacting transactivator with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p34.2 |
| NCBI Gene ID | 163732 ncbi.nlm.nih.gov/gene/163732 |
| Ensembl ID | ENSG00000179862 |
| UniProt ID | Q96RK1 |
| OMIM ID | 608960 |
| HGNC ID | 18695 |
| 基因别名 | CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4 |
基因功能与研究简介
CITED4(Cbp/p300-interacting transactivator with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain 4)是CITED家族成员,编码一种转录共激活因子,通过结合CBP/p300等转录共激活因子参与基因表达调控。CITED4在多种组织中表达,参与细胞增殖、分化、凋亡等过程。研究表明,CITED4在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子,具体作用取决于组织类型。此外,CITED4还参与心脏发育和血管生成等生理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | CITED4在乳腺癌中表达下调,可能通过抑制细胞增殖和诱导凋亡发挥肿瘤抑制作用。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | CITED4在结直肠癌中表达下调,与肿瘤进展和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | CITED4在非小细胞肺癌中表达下调,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 肝癌 | CITED4在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响Wnt/β-catenin通路参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 心脏发育异常 | CITED4参与心脏发育,其表达异常可能与先天性心脏病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致CITED4蛋白功能缺失或降低,可能通过单倍剂量不足或显性负效应影响细胞功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明CITED4存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负效应):目前暂无明确证据表明CITED4存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003713 transcription coactivator activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0008283 cell population proliferation |
| • GO:0006915 apoptotic process |
相关通路
• hsa05200 Pathways in cancer
• hsa04110 Cell cycle
• hsa04210 Apoptosis
蛋白质功能简介
CITED4蛋白由269个氨基酸组成,包含一个保守的CITED结构域,该结构域介导与CBP/p300的相互作用。CITED4主要定位于细胞核,作为转录共激活因子,通过招募CBP/p300等组蛋白乙酰转移酶促进基因转录。CITED4参与调控细胞增殖、凋亡、分化等过程,其表达异常与多种肿瘤的发生发展相关。