CKS1B基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞周期调控研究
CKS1B是细胞周期调控和泛素-蛋白酶体系统的关键因子,其异常表达与多种癌症的发生发展密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | CKS1B |
|---|---|
| 基因全名 | CDC28 protein kinase regulatory subunit 1B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q21.3 |
| NCBI Gene ID | 1163 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1163 |
| Ensembl ID | ENSG00000173207 |
| UniProt ID | P61024 |
| OMIM ID | 116900 |
| HGNC ID | 19083 |
| 基因别名 | CKS1, CKS1B, ckshs1, CKS-1, CKS1B protein |
基因功能与研究简介
CKS1B(CDC28蛋白激酶调节亚基1B)是细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的调节亚基,参与细胞周期G1/S和G2/M转换的调控。CKS1B是SCF(SKP1-CUL1-F-box蛋白)泛素连接酶复合物的组成部分,通过结合SKP2促进细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂p27Kip1的泛素化降解,从而调控细胞增殖。CKS1B在多种癌症中高表达,与肿瘤的发生、发展和不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多发性骨髓瘤 | CKS1B基因扩增和过表达导致p27Kip1降解增加,促进细胞周期进展和肿瘤增殖,与疾病进展和不良预后相关。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | CKS1B高表达与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过调控p27Kip1水平影响细胞增殖。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | CKS1B过表达与前列腺癌的进展和转移相关,可能通过促进细胞周期和抑制凋亡发挥作用。 | 具有较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | CKS1B在肝细胞癌中高表达,与肿瘤分期和预后不良相关,可能通过调控p27Kip1和细胞周期促进肿瘤生长。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | CKS1B在非小细胞肺癌中表达上调,与肿瘤增殖和不良预后相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性髓系白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 基因扩增 | 拷贝数变异 | 多发性骨髓瘤中常见 | 导致CKS1B过表达,促进细胞增殖 |
| 过表达 | 表达失调 | 多种癌症中常见 | 导致p27Kip1降解增加,促进细胞周期进展 |
| rs2232000 | SNP | 人群频率未知 | 可能影响基因表达或剪接,但功能影响尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明CKS1B存在致病性功能缺失突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
CKS1B基因扩增或过表达属于功能获得性改变,导致其蛋白水平升高,促进p27Kip1降解,加速细胞周期,与肿瘤发生相关。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明CKS1B存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0008283 cell population proliferation |
| • GO:0016567 protein ubiquitination | • GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process |
相关通路
• Cell Cycle
• Ubiquitin mediated proteolysis
• p53 signaling pathway
• Proteoglycans in cancer
蛋白质功能简介
CKS1B蛋白由79个氨基酸组成,包含一个保守的CKS结构域,能够与CDK2和SKP2相互作用。作为SCF复合物的衔接蛋白,CKS1B将SKP2与底物p27Kip1连接,促进p27Kip1的泛素化降解,从而调控细胞周期从G1期到S期的转换。CKS1B在增殖细胞中高表达,在分化细胞中低表达。其表达受转录因子E2F调控,并参与DNA损伤应答。