CLDN16基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CLDN16编码紧密连接蛋白claudin-16,在肾脏镁和钙重吸收中起关键作用,其突变导致家族性低镁血症高钙尿症肾钙质沉着症。

基因信息卡

基因符号 CLDN16
基因全名 claudin 16
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q28
NCBI Gene ID 10686 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10686
Ensembl ID ENSG00000164077
UniProt ID Q9Y5I7
OMIM ID 603959
HGNC ID 2037
基因别名 PCLN-1, PCLN1, HOMG3

基因功能与研究简介

CLDN16基因编码claudin-16蛋白,属于claudin家族,是紧密连接的重要组成部分。该蛋白主要表达于肾脏髓袢升支粗段,参与镁和钙的细胞旁路重吸收。CLDN16突变可导致家族性低镁血症高钙尿症肾钙质沉着症(FHHNC),表现为肾性镁丢失、高钙尿症和肾钙质沉着。此外,CLDN16在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
家族性低镁血症高钙尿症肾钙质沉着症 CLDN16突变导致紧密连接功能障碍,影响肾脏镁和钙重吸收,引起低镁血症、高钙尿症和肾钙质沉着。 已明确致病
肾结石 CLDN16功能异常可能导致尿钙排泄增加,促进肾结石形成。 具有较强研究证据
肿瘤 CLDN16在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞间连接和信号通路参与肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
肾小管上皮细胞 暂无可靠数据 高表达
其他细胞系 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.593G>A (p.Gly198Asp) 错义突变 常见突变 可能影响蛋白结构,导致功能丧失
c.716C>T (p.Pro239Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白定位或功能
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白合成异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数CLDN16突变导致功能丧失,影响紧密连接对镁和钙的通透性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能具有显性负效应,干扰正常蛋白功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005198 (structural molecule activity) • GO:0005887 (integral component of plasma membrane)
• GO:0005911 (cell-cell junction) • GO:0016324 (apicolateral plasma membrane)
• GO:0030054 (cell junction) • GO:0070062 (extracellular exosome)

相关通路

hsa04530 (Tight junction)
hsa04976 (Bile secretion)
hsa04964 (Proximal tubule bicarbonate reclamation)

蛋白质功能简介

claudin-16是紧密连接蛋白,属于claudin家族。它主要表达于肾脏髓袢升支粗段,参与细胞旁路阳离子选择性转运,特别是镁和钙的重吸收。蛋白包含四个跨膜结构域,两个胞外环,N-和C-末端位于胞内。其功能依赖于与其他claudin蛋白的相互作用。突变导致蛋白功能异常,引起肾脏镁钙代谢紊乱。

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