CLDN18基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
CLDN18编码紧密连接蛋白claudin-18,在胃黏膜屏障中发挥关键作用,其异常表达与胃癌、胰腺癌等恶性肿瘤密切相关,是潜在的诊断标志物和治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | CLDN18 |
|---|---|
| 基因全名 | claudin 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q22.3 |
| NCBI Gene ID | 51208 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51208 |
| Ensembl ID | ENSG00000063394 |
| UniProt ID | P56856 |
| OMIM ID | 609210 |
| HGNC ID | 2039 |
| 基因别名 | CLDN18.1, CLDN18.2 |
基因功能与研究简介
CLDN18基因编码claudin-18蛋白,属于claudin家族,是紧密连接的主要组成部分,参与维持细胞极性、调节细胞旁通透性。CLDN18在正常胃黏膜中高表达,在多种肿瘤中异常表达,尤其是胃癌和胰腺癌。CLDN18.2亚型在癌细胞中暴露,成为抗体药物靶点(如zolbetuximab)。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胃癌 | CLDN18.2在胃癌中高表达,与肿瘤进展和不良预后相关。 | 已明确致病 |
| 胰腺癌 | CLDN18.2在胰腺癌中异常表达,可能参与肿瘤发生。 | 具有较强研究证据 |
| 食管癌 | CLDN18.2在部分食管癌中表达,可能作为治疗靶点。 | 潜在关联 |
| 卵巢癌 | CLDN18.2在卵巢癌中表达,但研究较少。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胃 | 高表达 | 正常胃黏膜中高表达 |
| 肺 | 低表达 | 正常肺组织中低表达 |
| 胰腺 | 低表达 | 正常胰腺中低表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MKN45 | 高表达 | 胃癌细胞系 |
| KATO III | 高表达 | 胃癌细胞系 |
| PANC-1 | 中等表达 | 胰腺癌细胞系 |
| 其他细胞系 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.203G>A (p.Arg68His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.407C>T (p.Pro136Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.559G>A (p.Gly187Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.694C>T (p.Arg232*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,可能破坏紧密连接结构,增加细胞旁通透性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明CLDN18存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
某些错义突变可能干扰正常蛋白功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005911 (cell-cell junction) | • GO:0005923 (bicellular tight junction) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0016327 (apicolateral plasma membrane) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Cell junction organization (Reactome: R-HSA-446728)
• Tight junction interactions (Reactome: R-HSA-420029)
蛋白质功能简介
CLDN18蛋白属于claudin家族,包含四个跨膜结构域,参与形成紧密连接。CLDN18有两种剪接变体:CLDN18.1和CLDN18.2,它们在第一个胞外环上存在差异。CLDN18.2在正常组织中表达受限,但在多种肿瘤中异常表达,成为癌症治疗的潜在靶点。