CLN8基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CLN8基因编码一种跨膜蛋白,参与脂质代谢和溶酶体功能,其突变可导致神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)和进行性肌阵挛癫痫。

基因信息卡

基因符号 CLN8
基因全名 CLN8 transmembrane ER and ERGIC protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 8p23.3
NCBI Gene ID 2055 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2055
Ensembl ID ENSG00000182372
UniProt ID Q9UBY8
OMIM ID 607837
HGNC ID 2079
基因别名 ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8; EPMR; FLJ38614; MGC126562

基因功能与研究简介

CLN8基因编码一种跨膜蛋白,主要定位于内质网(ER)和内质网-高尔基体中间区室(ERGIC)。该蛋白参与脂质代谢、溶酶体功能以及细胞应激反应。CLN8基因突变与神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)和进行性肌阵挛癫痫(EPMR)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL) CLN8基因突变导致溶酶体功能障碍,引起脂褐质沉积,导致神经退行性变。 已明确致病
进行性肌阵挛癫痫(EPMR) CLN8基因突变导致神经元功能异常,引起肌阵挛和癫痫发作。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 错义/起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白功能丧失
c.200C>T (p.Pro67Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构
c.535C>T (p.Arg179*) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

多数CLN8突变导致蛋白功能丧失,如无义突变、移码突变等。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005793 (endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment)
• GO:0006629 (lipid metabolic process) • GO:0007040 (lysosome organization)
• GO:0030659 (cytoplasmic vesicle membrane)

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

CLN8蛋白是一种跨膜蛋白,定位于内质网(ER)和内质网-高尔基体中间区室(ERGIC)。它参与脂质代谢、溶酶体功能以及细胞应激反应。CLN8蛋白可能通过调节脂质合成或转运来维持细胞稳态。其功能丧失与神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)和进行性肌阵挛癫痫(EPMR)相关。

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