CLTC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CLTC编码网格蛋白重链,参与细胞内囊泡运输,其突变与神经系统疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 CLTC
基因全名 clathrin heavy chain
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q23.1
NCBI Gene ID 1213 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1213
Ensembl ID ENSG00000141367
UniProt ID Q00610
OMIM ID 118955
HGNC ID 2092
基因别名 CHC, CHC17, CLTCL2, DKFZp686M132, FLJ38942, Hc, KIAA0034

基因功能与研究简介

CLTC基因编码网格蛋白重链(clathrin heavy chain),是网格蛋白三聚体(triskelion)的主要结构成分。网格蛋白介导细胞内囊泡的形成,参与受体介导的内吞作用、突触囊泡回收以及细胞内物质运输。CLTC在多种组织中广泛表达,尤其在神经元中高表达。CLTC基因突变可导致智力障碍、癫痫等神经系统疾病,并与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
智力障碍-癫痫综合征 已明确致病 OMIM
小头畸形 已明确致病 OMIM
乳腺癌 癌症相关 COSMIC
肺癌 癌症相关 COSMIC
白血病 癌症相关 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SH-SY5Y 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1615C>T (p.Arg539*) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1135A>G (p.Thr379Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1918G>A (p.Gly640Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使网格蛋白重链功能丧失,影响囊泡运输。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明CLTC突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):部分错义突变可能干扰网格蛋白三聚体的组装,产生显性负性效应,但具体机制尚需研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005198 (structural molecule activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0006897 (endocytosis)
• GO:0030136 (clathrin-coated vesicle) • GO:0043234 (protein-containing complex)

相关通路

Endocytosis (WP1820)
Clathrin-mediated endocytosis (R-HSA-8856825)
Synaptic vesicle cycle (R-HSA-421837)

蛋白质功能简介

CLTC编码的网格蛋白重链是网格蛋白三聚体的核心亚基,与轻链(CLTA、CLTB)共同形成网格蛋白笼形结构,介导细胞膜内陷和囊泡形成。该蛋白在受体介导的内吞、突触囊泡回收、细胞分裂等过程中发挥关键作用。CLTC突变可导致蛋白功能异常,影响神经发育和肿瘤发生。

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