CNOT2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

CNOT2是CCR4-NOT复合物的核心亚基,调控基因表达和mRNA降解,与神经发育及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 CNOT2
基因全名 CCR4-NOT transcription complex subunit 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.31
NCBI Gene ID 4848 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4848
Ensembl ID ENSG00000111596
UniProt ID Q9NZN8
OMIM ID 604909
HGNC ID 7878
基因别名 CDC36, HSPC131, NOT2, NOT2H

基因功能与研究简介

CNOT2(CCR4-NOT转录复合物亚基2)是CCR4-NOT复合物的核心成分,该复合物在基因表达调控中发挥关键作用,包括转录调控、mRNA降解和翻译抑制。CNOT2参与多种细胞过程,如细胞增殖、分化和凋亡。研究表明,CNOT2功能异常与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神发育迟滞 CNOT2突变导致单倍剂量不足,影响神经发育相关基因的表达,已明确致病 ClinVar, OMIM
小头畸形 CNOT2突变与神经发育异常相关,可能通过影响脑发育相关基因表达导致小头畸形,具有较强研究证据 ClinVar, PubMed
结直肠癌 CNOT2在结直肠癌中表达异常,可能通过调控细胞周期和凋亡相关基因影响肿瘤发生,具有较强研究证据 COSMIC, PubMed
乳腺癌 CNOT2在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤增殖和转移,潜在关联 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.457C>T (p.Arg153*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能引起单倍剂量不足
c.1042C>T (p.Arg348Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响待研究
c.1234delA (p.Thr412Profs*23) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能引起单倍剂量不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):CNOT2突变导致蛋白功能丧失或单倍剂量不足,影响CCR4-NOT复合物功能,导致基因表达调控异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明CNOT2存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明CNOT2突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0030014 CCR4-NOT complex • GO:0000287 magnesium ion binding
• GO:0003723 RNA binding • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006402 mRNA catabolic process

相关通路

hsa03018 RNA degradation
hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis
hsa05169 Epstein-Barr virus infection

蛋白质功能简介

CNOT2蛋白是CCR4-NOT复合物的亚基,该复合物具有多种酶活性,包括去腺苷酸化和泛素化。CNOT2包含一个NOT2_3_5结构域,参与蛋白相互作用。CNOT2在细胞核中表达,参与mRNA代谢和基因表达调控。

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