COCH基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COCH基因编码耳蜗蛋白,其突变与DFNA9型常染色体显性遗传性听力损失和眩晕综合征密切相关。

基因信息卡

基因符号 COCH
基因全名 coagulation factor C homolog, cochlin
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q12
NCBI Gene ID 1690 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1690
Ensembl ID ENSG00000104880
UniProt ID O43405
OMIM ID 603196
HGNC ID 2180
基因别名 COCH-5B2, DFNA9

基因功能与研究简介

COCH基因编码一种细胞外基质蛋白,称为耳蜗蛋白(cochlin),主要在耳蜗和前庭中高表达。该蛋白包含一个LCCL结构域和两个von Willebrand因子A样结构域,参与内耳细胞外基质的组织与稳态。COCH基因突变是常染色体显性遗传性听力损失和眩晕综合征(DFNA9)的主要致病原因。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
DFNA9型非综合征性听力损失伴眩晕 COCH基因突变导致耳蜗蛋白结构异常,影响内耳细胞外基质,引起进行性听力下降和前庭功能障碍。 已明确致病(OMIM 603196)
梅尼埃病 部分研究提示COCH基因变异可能增加梅尼埃病风险,但证据尚不充分。 潜在关联(ClinVar)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
耳蜗 暂无可靠数据 高表达
前庭 暂无可靠数据 高表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.151C>T (p.Pro51Ser) 错义突变 常见于DFNA9家系 可能影响LCCL结构域,导致蛋白错误折叠和功能丧失
c.209G>A (p.Arg70His) 错义突变 少见 可能影响蛋白分泌或结构稳定性
c.443C>T (p.Pro148Leu) 错义突变 少见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

部分错义突变可能导致蛋白功能丧失或结构异常,影响内耳细胞外基质稳态。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

DFNA9相关突变可能通过显性负效应干扰正常耳蜗蛋白的功能,但具体机制需进一步研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576 extracellular region • GO:0005615 extracellular space
• GO:0030020 extracellular matrix structural constituent • GO:0007605 sensory perception of sound
• GO:0050957 mechanosensory behavior

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

COCH基因编码的耳蜗蛋白(cochlin)是内耳细胞外基质的主要成分,包含一个LCCL结构域和两个VWA结构域。该蛋白在维持内耳结构稳定和听觉功能中发挥重要作用。突变导致蛋白结构异常,引发DFNA9型听力损失和眩晕。

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