COL13A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
COL13A1编码XIII型胶原蛋白α1链,参与细胞-基质黏附,其突变与先天性肌无力综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | COL13A1 |
|---|---|
| 基因全名 | collagen type XIII alpha 1 chain |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 10q22.1 |
| NCBI Gene ID | 1305 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1305 |
| Ensembl ID | ENSG00000197467 |
| UniProt ID | Q5TAT6 |
| OMIM ID | 120350 |
| HGNC ID | 2190 |
| 基因别名 | COL13A1, collagen XIII alpha 1 chain, COLXIII |
基因功能与研究简介
COL13A1基因编码XIII型胶原蛋白的α1链,属于非纤维性胶原蛋白,具有跨膜结构域,主要表达于细胞表面,参与细胞-基质黏附、细胞迁移和信号转导。该基因突变与先天性肌无力综合征(CMS)相关,尤其是突触前膜缺陷型。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性肌无力综合征 | COL13A1突变导致突触前膜乙酰胆碱释放异常,影响神经肌肉接头传递,表现为肌无力、眼睑下垂等症状。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | 部分研究提示COL13A1在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 人脐静脉内皮细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1576C>T (p.Arg526Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1627G>A (p.Gly543Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致COL13A1蛋白功能丧失或减少,影响神经肌肉接头形成和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005581 (collagen trimer) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• 胶原蛋白生物合成与修饰
• 细胞外基质组织
蛋白质功能简介
COL13A1蛋白是XIII型胶原蛋白的α1链,属于跨膜胶原蛋白,包含胶原结构域和跨膜结构域。它形成同源三聚体,参与细胞-基质黏附,在神经肌肉接头中富集,对突触前膜的结构和功能至关重要。