COL1A2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COL1A2基因编码I型胶原蛋白的α2链,是骨骼、皮肤和结缔组织的重要结构蛋白,其突变可导致多种遗传性结缔组织疾病。

基因信息卡

基因符号 COL1A2
基因全名 collagen type I alpha 2 chain
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q21.3
NCBI Gene ID 1278 ncbi.nlm.nih.gov/gene/1278
Ensembl ID ENSG00000164692
UniProt ID P08123
OMIM ID 120160
HGNC ID 2198
基因别名 OI4; EDSCV; EDSCL1; CAFYD; COL1A2

基因功能与研究简介

COL1A2基因编码I型胶原蛋白的α2链,是人体中最丰富的胶原蛋白类型。I型胶原蛋白是骨骼、皮肤、肌腱和韧带等结缔组织的主要结构蛋白,由两条α1链和一条α2链组成三螺旋结构。COL1A2基因的突变可导致多种遗传性疾病,包括成骨不全(OI)、Ehlers-Danlos综合征(EDS)等。此外,该基因的体细胞突变也与某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
成骨不全 COL1A2基因突变导致I型胶原蛋白结构异常,影响骨骼矿化和强度,导致骨质疏松和骨折。 已明确致病
Ehlers-Danlos综合征(经典型) COL1A2基因突变导致胶原蛋白结构异常,影响皮肤和关节的结缔组织,导致皮肤过度伸展、关节活动度过大等。 已明确致病
特发性骨质疏松症 COL1A2基因多态性可能增加骨质疏松症的风险,但证据尚不充分。 潜在关联
癌症 COL1A2基因在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤微环境的调控,但具体机制尚在研究中。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼 暂无可靠数据 高表达
皮肤 暂无可靠数据 高表达
肌腱 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
成骨细胞 暂无可靠数据 高表达
成纤维细胞 暂无可靠数据 高表达
软骨细胞 暂无可靠数据 中等表达
上皮细胞 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1170+1G>A 剪接位点突变 罕见 导致外显子跳跃,产生截短蛋白,功能丧失
p.Gly256Ser 错义突变 罕见 破坏三螺旋结构,显性负性效应
p.Gly565Val 错义突变 罕见 破坏三螺旋结构,显性负性效应
c.970_972del 移码突变 罕见 导致提前终止密码子,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变、移码突变,导致COL1A2蛋白缺失或截短,影响胶原蛋白合成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明COL1A2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,如错义突变,产生的异常α2链可干扰正常三螺旋形成,导致胶原蛋白结构异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005201 (extracellular matrix structural constituent) • GO:0005581 (collagen trimer)
• GO:0030198 (extracellular matrix organization) • GO:0001501 (skeletal system development)
• GO:0005576 (extracellular region)

相关通路

hsa04510 (Focal adhesion)
hsa04512 (ECM-receptor interaction)
hsa04974 (Protein digestion and absorption)
hsa05146 (Amoebiasis)

蛋白质功能简介

COL1A2蛋白是I型胶原蛋白的α2链,与α1链共同构成三螺旋结构。该蛋白富含甘氨酸-脯氨酸-羟脯氨酸重复序列,对维持胶原蛋白的结构稳定性至关重要。COL1A2蛋白在骨骼、皮肤、肌腱等结缔组织中高表达,参与细胞外基质的构建和重塑。

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