COL23A1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
COL23A1编码胶原蛋白XXIII,参与细胞黏附与肿瘤进展,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | COL23A1 |
|---|---|
| 基因全名 | collagen type XXIII alpha 1 chain |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q35.3 |
| NCBI Gene ID | 255631 ncbi.nlm.nih.gov/gene/255631 |
| Ensembl ID | ENSG00000137801 |
| UniProt ID | Q86Y22 |
| OMIM ID | 610036 |
| HGNC ID | 29390 |
| 基因别名 | COL23A1, collagen XXIII, FLJ22983 |
基因功能与研究简介
COL23A1基因编码胶原蛋白XXIII,属于跨膜胶原蛋白家族。该蛋白包含一个N端信号肽、一个跨膜结构域和多个胶原蛋白重复序列。COL23A1在多种组织中表达,尤其在肺、肾和胎盘中水平较高。研究表明,COL23A1参与细胞黏附、迁移和肿瘤进展,在多种癌症中表达异常,可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非小细胞肺癌 | COL23A1在非小细胞肺癌中高表达,可能促进肿瘤细胞迁移和侵袭,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | COL23A1在乳腺癌中表达上调,可能通过影响细胞外基质重塑促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | COL23A1在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤微环境调控。 | 潜在关联 |
| 前列腺癌 | COL23A1在前列腺癌中表达升高,可能促进肿瘤转移。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明COL23A1突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明COL23A1突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明COL23A1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0005581 (collagen trimer) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
COL23A1编码的胶原蛋白XXIII是一种跨膜蛋白,属于胶原蛋白家族。该蛋白包含多个胶原蛋白重复序列,可能参与细胞外基质的组成和细胞黏附过程。研究表明,COL23A1在多种肿瘤中表达上调,可能通过促进细胞迁移和侵袭参与肿瘤进展。然而,其具体分子机制尚不完全清楚,需要进一步研究。