COL27A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
COL27A1编码胶原蛋白XXVII α1链,是骨骼发育和软骨形成的关键基因,其突变与Steel综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | COL27A1 |
|---|---|
| 基因全名 | collagen type XXVII alpha 1 chain |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q32 |
| NCBI Gene ID | 85301 ncbi.nlm.nih.gov/gene/85301 |
| Ensembl ID | ENSG00000177679 |
| UniProt ID | Q8IZC6 |
| OMIM ID | 608461 |
| HGNC ID | 22286 |
| 基因别名 | COL27A1, collagen alpha-1(XXVII) chain |
基因功能与研究简介
COL27A1基因编码胶原蛋白XXVII α1链,属于胶原蛋白家族。该蛋白是软骨和骨骼发育过程中的重要结构成分,参与细胞外基质的组装和矿化。COL27A1在胚胎发育中高表达,尤其在软骨和骨骼中。其突变可导致Steel综合征,表现为骨骼发育异常。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Steel综合征 | COL27A1基因突变导致胶原蛋白XXVII α1链功能异常,影响软骨和骨骼发育,导致骨骼畸形、关节挛缩等表型。 | 已明确致病 |
| 骨关节炎 | COL27A1表达水平变化可能与骨关节炎的病理过程相关,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 软骨 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 软骨细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 成骨细胞 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2089C>T (p.Arg697Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1234G>A (p.Gly412Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解,导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
错义突变可能产生异常蛋白,干扰正常胶原蛋白的组装,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005201 (extracellular matrix structural constituent) | • GO:0005581 (collagen trimer) |
| • GO:0031012 (extracellular matrix) | • GO:0005576 (extracellular region) |
相关通路
• Collagen biosynthesis and modifying enzymes (R-HSA-1650814)
• Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures (R-HSA-2022090)
蛋白质功能简介
COL27A1编码的胶原蛋白XXVII α1链是胶原蛋白家族成员,主要存在于软骨和骨骼的细胞外基质中。该蛋白含有胶原蛋白特有的Gly-X-Y重复序列,形成三螺旋结构。COL27A1在骨骼发育中起关键作用,其突变可导致Steel综合征。