COL27A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

COL27A1编码胶原蛋白XXVII α1链,是骨骼发育和软骨形成的关键基因,其突变与Steel综合征相关。

基因信息卡

基因符号 COL27A1
基因全名 collagen type XXVII alpha 1 chain
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q32
NCBI Gene ID 85301 ncbi.nlm.nih.gov/gene/85301
Ensembl ID ENSG00000177679
UniProt ID Q8IZC6
OMIM ID 608461
HGNC ID 22286
基因别名 COL27A1, collagen alpha-1(XXVII) chain

基因功能与研究简介

COL27A1基因编码胶原蛋白XXVII α1链,属于胶原蛋白家族。该蛋白是软骨和骨骼发育过程中的重要结构成分,参与细胞外基质的组装和矿化。COL27A1在胚胎发育中高表达,尤其在软骨和骨骼中。其突变可导致Steel综合征,表现为骨骼发育异常。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Steel综合征 COL27A1基因突变导致胶原蛋白XXVII α1链功能异常,影响软骨和骨骼发育,导致骨骼畸形、关节挛缩等表型。 已明确致病
骨关节炎 COL27A1表达水平变化可能与骨关节炎的病理过程相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
软骨 暂无可靠数据 高表达
骨骼 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
软骨细胞 暂无可靠数据 高表达
成骨细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2089C>T (p.Arg697Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1234G>A (p.Gly412Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解,导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

错义突变可能产生异常蛋白,干扰正常胶原蛋白的组装,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005201 (extracellular matrix structural constituent) • GO:0005581 (collagen trimer)
• GO:0031012 (extracellular matrix) • GO:0005576 (extracellular region)

相关通路

Collagen biosynthesis and modifying enzymes (R-HSA-1650814)
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures (R-HSA-2022090)

蛋白质功能简介

COL27A1编码的胶原蛋白XXVII α1链是胶原蛋白家族成员,主要存在于软骨和骨骼的细胞外基质中。该蛋白含有胶原蛋白特有的Gly-X-Y重复序列,形成三螺旋结构。COL27A1在骨骼发育中起关键作用,其突变可导致Steel综合征。

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